顶刊发布|农作物多组学资源平台重磅上线!

花生是全球重要油料与经济作物,虽已有部分基因组和转录组研究,但缺乏覆盖全生育期、多组织的多组学整合资源平台 。相较于水稻、番茄等作物完善的多组学数据库,花生一直缺少统一的数据整合、在线分析、基因挖掘的公共平台,极大限制了基因功能解析、发育调控机制解析及分子育种进度。

河南农业大学殷冬梅教授联合上海交通大学韦朝春教授研究团队,构建了花生全生育期22个组织转录组、蛋白质组与代谢组的全景图谱,并推出首个花生多组学数据平台PeanutOmics(https://cgm.sjtu.edu.cn/PeanutOmics),填补花生组学资源整合空白。

1数据库主页图片

1.数据库资源规模

1.构建花生 22 个组织多组学表达全景图谱

鉴定到 53030 个表达基因、12826 个蛋白证据基因、2035 个代谢物,系统解析不同组织 / 发育阶段基因、蛋白、代谢物表达特征,明确营养与生殖组织表达分化规律。

2.挖掘大量新蛋白与微蛋白资源

鉴定出 2147 个编码新蛋白基因、274 个微蛋白(sORF 编码);挖掘 DEF3、TANGO、WDR13、SLR1-BP、SLE2 等发育与抗病关键候选基因。

3.基因共表达与调控网络解析

利用 WGCNA 鉴定 24 个共表达模块,各模块具有明显组织特异性;重点解析果针组织IAA/ARF 激素调控网络,阐明激素信号调控果针发育的分子机制。

图2 数据库资源信息

2.数据库功能模块

✅ 基因组浏览器:基因结构、注释信息、多组织表达谱可视化浏览

✅ 多组学表达查询:基因 / 蛋白 / 代谢物时空表达模式一键检索

✅ BLAT 同源比对:快速定位同源基因与基因组共线性区域

✅ 蛋白互作网络:挖掘核心 Hub 基因与通路调控关系

✅ 多组学联合分析:支持转录 - 蛋白 - 代谢关联挖掘与通路富集

3.总结

PeanutOmics 作为花生一体化多组学公共平台,实现转录组 - 蛋白组 - 代谢组资源整合与在线分析,极大丰富花生组学资源库。

凌恩生物可依托植物多组学整合分析 + 数据库构建成熟分析流程,为作物、林木、经济植物提供多组学联合解析、核心基因挖掘、数据库搭建一站式科研服务,助力客户发表高分文章与平台成果转化。

参考文献

Xue H, Zhao K, Dong X, at. PeanutOmics: A comprehensive platform with an integrative multi-omics atlas for peanut research, Plant Commun, 2026

原文链接

doi: 10.1016/j.xplc.2025.101622.

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