2024年10月，凌恩生物助力客户发表文章86篇，累计影响因子452.1分，其中包括Advanced Functional Materials、Journal of Hazardous Materials、Journal of Advanced Research、Water Research、Environmental Science & Technology、The ISME Journal、Journal of Nanobiotechnology、Plant Cell等期刊文章。此次收录的文章涵盖多个研究方向，其中多组学研究33篇，微生物方向29篇，基因组方向27篇，转录组方向24篇，代谢组方向12篇，宏基因组方向9篇，eDNA方向3篇，云平台方向3篇。
接下来小编挑选了一些高分文章，让我们一起回顾一下吧~
第1篇 工程化多功能生物酶BioHJzyme通过调节D-Band中心促进肿瘤切除术后感染创伤再生
**英文题目：**Engineered Multifunctional BioHJzyme via Tuning D-Band Center for Postoperative Infected Wound Regeneration of Tumor Resection
发表期刊： Advanced Functional Materials
影响因子：18.5
作者单位： 四川大学
涉及的凌恩生物服务产品： 转录组分析
**主要研究内容：**本研究设计了一种名为BioHJzyme的材料 ，它是由锌碲酸盐/二氧化锰和葡萄糖氧化酶（GOx）组成，具备抗肿瘤和抗菌性能，适用于肿瘤术后感染伤口的再生。GOx通过消耗葡萄糖产生H₂O₂，阻断葡萄糖代谢。BioHJzyme可通过模拟过氧化物酶（POD）活性催化生成的H₂O₂转化为具有高致命性的•OH，降低了催化过程中中间体的吸附能，同时H₂O₂和Mn²⁺产生的氧气可被催化为¹O₂。其模拟谷胱甘肽过氧化物酶（GPx）活性能够破坏肿瘤的抗氧化系统。体内研究显示，BioHJzyme通过•OH/¹O₂的生成对细菌和肿瘤表现出强大的抑制能力，并且由于碲的作用促进了细胞凋亡。此外，BioHJzyme还能通过调节M1/M2巨噬细胞和促进血管生成/胶原沉积加速皮肤再生。
第2篇 模块化卫星纳米颗粒用于治疗脑缺血再灌注损伤
**英文题目：**Modular Satellite Nanoparticles for Remedying Primary and Secondary Injury in Cerebral Ischemia-Reperfusion
发表期刊： Advanced Functional Materials
影响因子：18.5
作者单位： 中国科技大学第一附属医院
涉及的凌恩生物服务产品： miRNA测序
**主要研究内容：**本研究介绍了一个名为MEps的卫星纳米粒子平台，该平台结合了骨髓间充质干细胞外泌体（Exos）的神经修复特性和巨噬细胞膜（MMs）的炎症位点靶向能力。MEps中的MMs和Exos就像卫星一样，确保了精确的定位和信息传输。MEps通过粘附分子与其受体的相互作用，在受损的脑血管内皮细胞上迅速形成保护性屏障，阻断中性粒细胞的浸润。随后，Exos中的修复因子修复受损细胞并启动神经发生。结果表明，该创新方法可在多个水平上有效减轻缺血-再灌注损伤，并表现出较强的生物相容性。该策略在减轻缺血-再灌注损伤方面具有临床应用前景。
第3篇 宏基因组学和宏转录组学揭示田间人工湿地抗生素抗性基因组与生态风险消除
**英文题目：**Antibiotic resistomes and ecological risk elimination in field-scale constructed wetland revealed by integrated metagenomics and metatranscriptomics
发表期刊：Journal of Hazardous Materials
影响因子：12.2
作者单位： 山东大学
涉及的凌恩生物服务产品： 抗性宏基因组+宏转录组
**主要研究内容：**本研究通过宏基因组学和宏转录组学系统研究了ARGs在实地规模人工湿地及其平行自然河流的水体、沉积物和植物中的分布、迁移、表达及宿主情况。结果显示，湿地处理过程中水体中的ARGs丰度和多样性逐渐降低，最终水中ARGs的去除率达到72.28%。溯源分析表明，水相ARGs的减少主要是由于ARGs在湿地沉积物和植物中的动态积累。在湿地处理过程中，变形菌门被确定为ARGs的主要宿主细菌，尤其是在沉积物和植物中。此外，尽管携带多种ARGs的ESKAPE病原体在整个湿地处理过程中持续存在于三种介质中，但ARGs的表达水平和风险在处理后显著降低。
第4篇 基于反刍动物胃肠道古细菌基因组图谱的肠道甲烷生成新见解
**英文题目：**New insights into the enteric methane production based on the archaeal genome map of ruminant gastrointestinal tract
发表期刊：Journal of Advanced Research
影响因子：11.4
作者单位： 浙江大学
涉及的凌恩生物服务产品：宏基因组binning+宏转录组
主要研究内容： 本研究构建了反刍动物胃肠道古菌catalog，全面探索肠道中古菌的分类和功能。对不同甲烷（CH4）产量的奶牛的瘤胃液样本进行了宏基因组学和宏转录组学分析。研究构建了包含405个菌株级非冗余古菌基因组的反刍动物GIT古菌基因catalog（RGAG），并调查了RGAG的功能异质性和甲烷生成结构。RGAG包含1,124个未知的微生物生物合成基因簇。RGAG携带的噬菌体调查发现了63个噬菌体，具有122个宿主有益基因和18个辅助代谢基因（AMGs）。高表达的甲烷球形菌属与甲烷产量呈负相关。本研究构建了反刍动物GIT古菌的统一基因组图谱，并明确了RGAG的多方面功能尚未被发现。
第5篇 阳离子对重力驱动膜系统中生物膜的影响：过滤性能和机理研究
**英文题目：**Effects of cations on biofilms in gravity-driven membrane system: Filtration performance and mechanism investigation
发表期刊：Water Research
影响因子：11.4
作者单位：哈尔滨工业大学
涉及的凌恩生物服务产品：二代16s扩增子+二代18s扩增子
**主要研究内容：**本研究使用典型阳离子（Ca2+和Na+）结合重力驱动膜（GDM）揭示去污行为和机制。结果表明，Ca2+ 提高了GDM的稳定通量和污染物去除效率，而 Na+ 对通量有不利影响。与 GDM 控制相比，Ca-GDM 中的污染物浓度较低。在 Ca-GDM 系统中观察到异质且松散的生物膜，增加了粗糙度和孔隙率，Na+则相反。细菌群落的丰富度在 Ca-GDM 系统中增加，而在Na-GDM系统中降低。 Ca-GDM体系中较高的三磷酸腺苷（ATP）浓度与丰富的细菌数量和高生物活性相一致，有利于污染物的高效去除。阳离子的加入改变了分子间作用力，Ca2+诱导的桥联效应导致絮体颗粒大而松散，而Na-GDM中水合分子的显著脱水导致聚集现象明显。
第6篇 长期光化学和微生物变化导致藻类和陆地溶解有机物成分趋同
**英文题目：**Long-Term Photochemical and Microbial Alterations Lead to the Compositional Convergence of Algal and Terrestrial Dissolved Organic Matter
发表期刊：Environmental Science & Technology
影响因子：10.8
作者单位：中国科学院南京地理与湖泊研究所
涉及的凌恩生物服务产品：二代16s扩增子
**主要研究内容：**本研究使用来自藻类和陆地来源的 DOM（分别为 DOMa 和 DOMt）进行了长期培养实验，分别采用单一光照、单一微生物和光与微生物联合处理。分别使用傅里叶变换离子回旋共振质谱和 16s rRNA 分析 DOM 分子组成和细菌群落。在光与微生物联合处理下，DOMa 和 DOMt 趋向于相似的组成，这是由于去除了不同来源的特异性分子以及产生富羧基脂环族分子（CRAM）所致。微生物过程在藻源DOM产生 CRAM过程中发挥了更大的作用，而光化学转化对陆源DOM中CRAM的产生则更为重要。陆源DOM的微生物降解可能需要更多的细菌合作。
第7篇 原生生物的捕食通过拮抗性微生物组相互作用促进抗生素耐药性的传播
**英文题目：**Protist predation promotes antimicrobial resistance spread through antagonistic microbiome interactions
**发表期刊：**The ISME Journal
影响因子：10.8
作者单位：南京农业大学
涉及的凌恩生物服务产品：抗性宏基因组+宏基因组binning+宏转录组+qPCR
**主要研究内容：**本研究揭示了土壤原生生物在塑造抗生素耐药性动态方面的关键作用，证明原生生物会导致抗生素耐药性的增加，并在机制上将这种增加与微生物组中抗菌活性的促进联系起来。原生生物的捕食为能够产生拮抗性次级代谢物的细菌提供了竞争优势，而这些次级代谢物反过来又促进了抗生素耐药性细菌的产生。本研究深入了解了原生生物和土壤微生物组在调节抗生素耐药性动态方面的复杂相互作用，强调了自上而下控制抗生素耐药性传播的重要性，并将其直接与微生物组中的跨界相互作用联系起来。
第8篇 二氧化硅纳米粒子通过微调氧化信号和根际细菌群落来抑制番茄中的青枯病
**英文题目：**Immunomodulating melatonin-decorated silica nanoparticles suppress bacterial wilt (Ralstonia solanacearum) in tomato (Solanum lycopersicum L.) through fine-tuning of oxidative signaling and rhizosphere bacterial community
发表期刊：Journal of Nanobiotechnology
影响因子：10.6
作者单位：浙江大学
涉及的凌恩生物服务产品：二代16s扩增子+靶向代谢组
**主要研究内容：**由植物病原菌青枯雷尔氏菌引起的青枯病是影响番茄产量的重要原因。最近，纳米技术在作物病害管理中显示出巨大的潜力。本研究调查了由生物源二氧化硅纳米颗粒 (SiNPs) 和褪黑激素 (MT) 组成的生物源纳米制剂 (BNFs) 在控制番茄青枯病方面的功效。结果表面SiNPs 和BNFs两种材料的尺寸分布相对均匀且形状一致。土壤施用BNFs的效果优于SiNPs，显著增强植物免疫力，降低番茄植物的青枯病发病率。此外，BNFs通过增强水杨酸的产生来诱导抗病性，激活与受感染番茄植株中的植物激素信号传导有关的防御相关基因。高通量16S rRNA测序表明，BNF促进了健康和患病植物中有益根际细菌的生长，同时抑制了受感染植物中青枯雷尔氏菌的丰度。
第9篇 病毒小干扰 RNA-宿主植物mRNA通路通过增强自噬调节病毒诱导的抗旱性
**英文题目：**A viral small interfering RNA-host plant mRNA pathway modulates virus-induced drought tolerance by enhancing autophagy
发表期刊：Plant Cell
影响因子：10
作者单位：中国计量大学
涉及的凌恩生物服务产品：真核有参转录组+small RNA
**主要研究内容：**菜豆感染豇豆轻斑驳病毒（CPMMV）后，在干旱和渗透胁迫下生长更佳，表现出VDT表型。VDT与细胞自噬相关，特别是菜豆自噬基因PvATG8c。本研究发现，病毒源小干扰RNA（vsiRNA6163）能跨界作用于菜豆，靶向PvTCP2基因，促进PvATG8c蛋白积累。PvATG8c下游靶标PvEDR15正调控气孔开度。研究提出vsiRNA6163-PvTCP2-PvATG8c-PvERD15分子模块介导VDT，通过降低气孔导度减少水分散失，增强抗旱性。该模型揭示了植物-生物-非生物胁迫的复杂互作，并发现只需CPMMV衍生的21 bp小RNA即可诱导VDT，为提高菜豆抗旱性提供新方法。
10月部分客户文章列表
凌恩以打造国内一流生物公司为目标，在科研测序领域深耕不辍，吸纳多名生物信息高级技术人员加盟，参与并完成多个高科技项目。现已在宏组学、基因组、表观遗传以及蛋白代谢等多组学及联合分析领域积累了深厚经验，打造出成熟的科研服务平台，以优质售前方案和优秀售后服务助力客户在高端国际期刊上发表了大量文章。