全新可重分析！代谢组质谱专用

摘要

代谢组学研究覆盖极为广阔的化学空间，产生大量实验数据，在化学、生物学及相关领域具备极高复用潜力。本文开发全新代谢组学质谱数据库MB‑POST，设计理念区别于现有平台，旨在充分释放上述数据价值。MB‑POST实现面向重分析的元数据框架，采集数据复用必需的关键信息；同时提供流程简化的数据提交系统，支持标准化代谢组学元数据与实验数据快速上传。该平台自2024年12月公开试点上线后，获得领域广泛使用，上线１年半时间内已存入170余个实验项目。因此，MB‑POST为代谢组学质谱数据的大规模复用奠定实践基础，是推动开放、数据驱动科学研究的１项实质性进展。

https://repository.massbank.jp

fmatsuda@ist.osaka‑u.ac.jp

okd@med.niigata‑u.ac.jp

#MBPOST #代谢组学 #质谱 #数据重分析 #元数据 #公共数据库 #FAIR原则 #MassBank

MB‑POST整体概念示意

代谢组学研究者提交附带高质量元数据的质谱数据集；MB‑POST定义的元数据满足重分析需求，同时保证输出数据可兼容MassBank；存入的数据支持后续重分析与复用，面向广大化学领域研究者开放，依托积累数据集开展重分析，进一步推动数据驱动的化学科学发展。

方法

元数据管理

图1 MB‑POST中「样本」预设模板输入界面截图

增量检索功能允许用户在预定义选项之外选择受控术语；

右侧面板展示关键元数据字段的上下文说明与填写示例。

图2 在项目内为文件分配预设配置文件的界面截图

用户通过顶部标签页选择待上传文件类型（原始数据、峰表、鉴定结果、生物学重复、其他）。针对原始数据文件，先从下方列表选择需要的预设组合，再将目标文件拖拽至页面虚线框区域，即可一次性为多个文件分配同一套预设配置。页面底部表格展示本项目全部文件列表，同时显示每个文件已经绑定的预设名称。

图3 MB‑POST元数据分配概念示意

用户创建单个「项目」用于存放提交数据集；1个项目可包含多类文件：原始数据、峰表数据、鉴定结果、重复样本数据。每个原始数据文件均分配来自4大元数据分类（样本、前处理、分析条件、软件设置）的预设组合。

结果与讨论

图4 从预设与项目注册到数据公开发布的完整工作流

撰写/修订稿件阶段（或为已发表论文注册数据）：创建预设、填写元数据；创建项目；选择、修改项目内待录入文件，将预设关联至原始数据；上传文件，完成提交。提交后项目在发布日期之前保持私有状态。同行评审阶段：生成仅审稿人可访问的预览链接与PIN验证码，将链接通知审稿人，继续进行稿件评审；根据审稿意见修订预设、元数据与项目内容。稿件接收后：设置项目发布日期，项目内容确认定稿，数据集对外公开发布。平台支持embargo（延迟公开）提交；项目尚未公开时，用户可直接修订提交内容，无需系统管理员介入。