技术栈
医学图像处理
裤裤兔
6 天前
医学影像
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医学图像处理
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影像处理
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脑科学
利用wfu pickatlas保存脑区ROI
搜索wfu pickatlas下载 https://www.nitrc.org/frs/download.php/10866/WFU_PickAtlas_3.zip/?i_agree=1&release_id=2885 解压至spm/toolbox下,用MATLAB导入路径 输入>>wfu_pickatlas 打开软件 软件界面: 选择AAL分区,再选择相应脑区(可多选) 在中间位置即可看到相应脑区mask(红色区域) 保存为mask:点击下方SAVE MASK按钮即可保存为nii格式的mask tips
裤裤兔
6 天前
影像分析
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医学影像
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医学图像处理
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影像处理
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医学图像
影像分割公开数据集
数据集：ISBI Neuronal Structure Segmentation Challenge 网址： https://www.nitrc.org/projects/ibsr https://www.nitrc.org/frs/multi-download.php/?i_agree=1&release_id=2309
柚子味的羊
1 个月前
深度学习
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医学图像处理
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torchio
TorchIO：超级好用的3D医学图像处理package
TorchIO 是一个非常重要的医学影像深度学习工具包，尤其在 MRI、CT、PET 等三维医学影像数据的预处理、增强和建模中应用广泛。它基于 PyTorch 构建，因此能无缝集成到你的神经网络训练流程中。
裤裤兔
1 年前
医学影像
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医学图像处理
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nifti
MATLAB截取图像的一部分并保存导出，在itksnap中3D展示
**问题描述：**输入nifti图像，截取图像的一部分并输出，比如截取图像的101010这一块，并导出为nii文件
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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深度学习
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机器学习
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医学图像处理
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医学人工智能
Nature Medicine病理AI汇总｜UNI：一种用于计算病理学的通用自监督基础模型·顶刊精析·24-10-31
今天分析Nature Medicine病理AI系列的第二篇文章——《Towards a general-purpose foundation model for computational pathology》
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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搜索引擎
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语言模型
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自然语言处理
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医学图像处理
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病理组学
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医学人工智能
未来医疗：大语言模型如何改变临床实践、研究和教育｜文献精析·24-10-23
这篇文章探讨了大型语言模型在医学领域的潜在应用和挑战，并讨论了它们在临床实践、医学研究和医学教育中的未来发展。
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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深度学习
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医学图像处理
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病理组学
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医学人工智能
深度学习在癌症基因组学和组织病理学中的应用与前景｜文献精析·24-10-16
这篇文章是关于深度学习（Deep Learning, DL）在癌症基因组学和组织病理学中的应用的综述。
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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深度学习
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医学图像处理
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病理组学
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医学人工智能
如何借助病理AI开展分子水平的研究？｜文献速递·24-10-17
今天的四篇文章跨度很大，从18年跨到24年。第一篇文章主要研究的是通过病理预测基因突变，要注意这篇文章发表的时间是2018年！！所以我们在看到这篇文章的简介时，会看到他们用的模型现在基本都没听人提到了。
罗小罗同学
1 年前
医学图像处理
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病理组学
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医学人工智能
肺腺癌预后新指标：全切片图像中三级淋巴结构密度的自动化量化｜文献精析·24-10-09
本期这篇文章，我去年分享过一次。当时发表在知乎上，没有标记参考文献，配图的清晰度也不够，并且分析的还不透彻，所以趁着国庆假期重新分析一下。
罗小罗同学
1 年前
医学图像处理
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病理组学
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三级淋巴结
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医学人工智能
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肝癌
肝内胆管癌中三级淋巴结构分布与临床预后的相关性研究｜文献精析·24-09-22
这篇文章是关于肝内胆管癌（intrahepatic cholangiocarcinoma, iCCA）中三级淋巴结构（tertiary lymphoid structures, TLSs）的分布、密度及其对临床结果的预测价值的研究。
罗小罗同学
1 年前
数据库
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人工智能
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医学图像处理
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医学人工智能
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渐冻症
困扰霍金和蔡磊等人的渐冻症，能否在医学AI领域寻找到下一个解决方案？｜个人观点·24-09-22
前沿探索：医学AI在渐冻症（Amyotrophic Lateral Sclerosis，ALS）领域的研究进展
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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机器学习
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自动化
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医学图像处理
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病理人工智能
JAMA network open|自动化定量评估胃肠道肿瘤中三级淋巴结构的机器学习模型｜文献精析·24-09-07
这篇文章报道了一种基于机器学习模型的自动化方法，用于在常规组织病理学图像中检测和分类胃肠道癌症中的三级淋巴结构，并验证了其与患者生存预后的关联。
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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深度学习
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机器学习
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医学图像处理
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医学人工智能
人工智能在子宫内膜癌领域的研究进展｜顶刊速递·24-08-12
本期推文主题：人工智能在子宫内膜癌领域中的研究进展昨天的推文主要介绍的是卵巢癌，有一小部分涉及到了子宫内膜癌，按照最新的规划，今天的推文是与子宫内膜癌相关的。
罗小罗同学
1 年前
人工智能
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深度学习
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机器学习
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医学图像处理
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医学人工智能
人工智能在病理组学领域的最新进展｜文献速递·24-08-09
本期推文主题：人工智能在病理组学领域的最新进展这一期推文和往期不太一样——往期几乎都是顶刊，而这一期选了一些分数不那么高的文章。这样做有两个原因：
Phoenixtree_DongZhao
1 年前
人工智能
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深度学习
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大模型
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医学图像处理
CLEFT 基于高效大语言模型和快速微调的语言-图像对比学习
github.compaperCLEFT是一种新型的对比语言图像预训练框架，专为医学图像而设计。它融合了医学LLM的预训练、高效微调和提示上下文学习，展现出卓越的性能！该框架由耶鲁大学研发。
Philo`
2 年前
论文阅读
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人工智能
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pytorch
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深度学习
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大模型
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sam
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医学图像处理
分割大模型论文阅读——SAMUS
期刊名： arXiv 期刊信息： 2023-9-13其余信息： 代码分割任意模型（SAM）是一种著名的通用图像分割模型，最近在医学图像分割领域引起了相当多的关注。尽管 SAM 在自然图像上表现出色，但在处理医学图像时**，尤其是涉及低对比度、模糊边界、复杂形状和小尺寸物体的图像时，它会遇到显着的性能下降和有限的泛化能力。** 在本文中，我们提出了 SAMUS，一种专为超声图像分割而定制的通用模型。与之前基于SAM的通用模型相比，SAMUS不仅追求更好的泛化性，而且还追求更低的部署成本，使其更适合临床应用。
悠眠小虫
2 年前
医学图像处理
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nifti
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itk-snap
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nii格式转换
医学图像处理：nii格式转换(3D切片为2D)
目录NIFTI文件结构读取NII文件ITK-SNAP安装使用方法NII转PNGNIFTI 格式，是一种用于存储和交换医学成像数据的文件格式，特别适用于神经影像学领域。NIFTI文件通常有两个扩展名：.nii（用于图像数据）和 .hdr（用于头文件，包含有关图像的元数据）。这两个文件是成对出现的，.hdr 文件包含有关图像数据的详细信息，如尺寸、方向、数据类型等，而 .nii 文件则包含实际的图像数据。
Metaphysicist.
2 年前
人工智能
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深度学习
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学习
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分类
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数据挖掘
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transformer
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医学图像处理
文献学习-38-用于增量组织病理学分类的内存高效提示调整
Memory-Efficient Prompt Tuning for Incremental Histopathology Classification Authors: Yu Zhu, Kang Li, Lequan Yu, Pheng-Ann Heng Source: The Thirty-Eighth AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI-24)
Metaphysicist.
2 年前
开发语言
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人工智能
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python
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深度学习
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音视频
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医学图像处理
文献学习-33-一个用于生成手术视频摘要的python库
Authors: Luis C. Garcia-Peraza-Herrera, Sebastien Ourselin, and Tom Vercauteren
Metaphysicist.
2 年前
图像处理
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人工智能
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深度学习
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transformer
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注意力机制
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医学图像处理
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图网络
文献学习-27-基于连通性感知图Transformer的数字病理图像乳腺癌分类
Authors: Kang Wang, Feiyang Zheng, Lan Cheng, Hong-Ning Dai, Qi Dou, Jing Qin, Member, IEEE