医学图像处理

罗小罗同学

Nature Medicine病理AI汇总｜UNI：一种用于计算病理学的通用自监督基础模型·顶刊精析·24-10-31今天分析Nature Medicine病理AI系列的第二篇文章——《Towards a general-purpose foundation model for computational pathology》

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未来医疗：大语言模型如何改变临床实践、研究和教育｜文献精析·24-10-23这篇文章探讨了大型语言模型在医学领域的潜在应用和挑战，并讨论了它们在临床实践、医学研究和医学教育中的未来发展。

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深度学习在癌症基因组学和组织病理学中的应用与前景｜文献精析·24-10-16这篇文章是关于深度学习（Deep Learning, DL）在癌症基因组学和组织病理学中的应用的综述。

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如何借助病理AI开展分子水平的研究？｜文献速递·24-10-17今天的四篇文章跨度很大，从18年跨到24年。第一篇文章主要研究的是通过病理预测基因突变，要注意这篇文章发表的时间是2018年！！所以我们在看到这篇文章的简介时，会看到他们用的模型现在基本都没听人提到了。

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肺腺癌预后新指标：全切片图像中三级淋巴结构密度的自动化量化｜文献精析·24-10-09本期这篇文章，我去年分享过一次。当时发表在知乎上，没有标记参考文献，配图的清晰度也不够，并且分析的还不透彻，所以趁着国庆假期重新分析一下。

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肝内胆管癌中三级淋巴结构分布与临床预后的相关性研究｜文献精析·24-09-22这篇文章是关于肝内胆管癌（intrahepatic cholangiocarcinoma, iCCA）中三级淋巴结构（tertiary lymphoid structures, TLSs）的分布、密度及其对临床结果的预测价值的研究。

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困扰霍金和蔡磊等人的渐冻症，能否在医学AI领域寻找到下一个解决方案？｜个人观点·24-09-22前沿探索：医学AI在渐冻症（Amyotrophic Lateral Sclerosis，ALS）领域的研究进展

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JAMA network open|自动化定量评估胃肠道肿瘤中三级淋巴结构的机器学习模型｜文献精析·24-09-07这篇文章报道了一种基于机器学习模型的自动化方法，用于在常规组织病理学图像中检测和分类胃肠道癌症中的三级淋巴结构，并验证了其与患者生存预后的关联。

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人工智能在子宫内膜癌领域的研究进展｜顶刊速递·24-08-12本期推文主题：人工智能在子宫内膜癌领域中的研究进展昨天的推文主要介绍的是卵巢癌，有一小部分涉及到了子宫内膜癌，按照最新的规划，今天的推文是与子宫内膜癌相关的。

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人工智能在病理组学领域的最新进展｜文献速递·24-08-09本期推文主题：人工智能在病理组学领域的最新进展这一期推文和往期不太一样——往期几乎都是顶刊，而这一期选了一些分数不那么高的文章。这样做有两个原因：

Phoenixtree_DongZhao

CLEFT 基于高效大语言模型和快速微调的语言-图像对比学习github.compaperCLEFT是一种新型的对比语言图像预训练框架，专为医学图像而设计。它融合了医学LLM的预训练、高效微调和提示上下文学习，展现出卓越的性能！该框架由耶鲁大学研发。

分割大模型论文阅读——SAMUS期刊名： arXiv 期刊信息： 2023-9-13其余信息：代码分割任意模型（SAM）是一种著名的通用图像分割模型，最近在医学图像分割领域引起了相当多的关注。尽管 SAM 在自然图像上表现出色，但在处理医学图像时**，尤其是涉及低对比度、模糊边界、复杂形状和小尺寸物体的图像时，它会遇到显着的性能下降和有限的泛化能力。** 在本文中，我们提出了 SAMUS，一种专为超声图像分割而定制的通用模型。与之前基于SAM的通用模型相比，SAMUS不仅追求更好的泛化性，而且还追求更低的部署成本，使其更适合临床应用。

医学图像处理：nii格式转换(3D切片为2D)目录NIFTI文件结构读取NII文件ITK-SNAP安装使用方法NII转PNGNIFTI 格式，是一种用于存储和交换医学成像数据的文件格式，特别适用于神经影像学领域。NIFTI文件通常有两个扩展名：.nii（用于图像数据）和 .hdr（用于头文件，包含有关图像的元数据）。这两个文件是成对出现的，.hdr 文件包含有关图像数据的详细信息，如尺寸、方向、数据类型等，而 .nii 文件则包含实际的图像数据。

文献学习-38-用于增量组织病理学分类的内存高效提示调整Memory-Efficient Prompt Tuning for Incremental Histopathology Classification Authors: Yu Zhu, Kang Li, Lequan Yu, Pheng-Ann Heng Source: The Thirty-Eighth AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI-24)

文献学习-33-一个用于生成手术视频摘要的python库Authors: Luis C. Garcia-Peraza-Herrera, Sebastien Ourselin, and Tom Vercauteren

文献学习-27-基于连通性感知图Transformer的数字病理图像乳腺癌分类Authors: Kang Wang, Feiyang Zheng, Lan Cheng, Hong-Ning Dai, Qi Dou, Jing Qin, Member, IEEE

文献学习-30-GRAB-Net: 用于医学点云分割的图的边界感知网络Authors: Yifan Liu, Wuyang Li, Jie Liu, Hui Chen, and Yixuan Yuan, Member, IEEE

文献学习-25-综合学习和适应性教学：用于病理性胶质瘤分级的多模态知识蒸馏Abstract多模态数据（例如病理切片和基因组图谱）的融合可以提供补充信息并有益于神经胶质瘤分级。然而，由于成本高和技术挑战，基因组图谱难以获得，从而限制了多模态诊断的临床应用。在这项工作中，调查了一个现实问题，即在训练期间可以使用配对的病理基因组数据，而只有病理切片可用于推理。针对这一问题，该文提出一种综合学习和适应性教学框架，通过将特权知识从多模态教师转移到病理学学生身上，提高病理分级模型的性能。为了全面学习多模态教师，提出了一种新颖的显著性感知掩蔽（SA-Mask）策略，通过掩蔽最显着的特征来探索

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基于Matlab的血管图像增强算法，Matlab实现博主简介：专注、专一于Matlab图像处理学习、交流，matlab图像代码代做/项目合作可以联系（QQ:3249726188）

文献学习-16-基于MRI引导机器人平台的心导管形状跟踪和反馈控制（用于房颤消融）Shape Tracking and Feedback Control of Cardiac Catheter Using MRI-Guided Robotic Platform—Validation With Pulmonary Vein Isolation Simulator in MRI