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CellFlow虚拟细胞论文阅读去年九月份，Virtual Cell Challenge开展之后，虚拟细胞（扰动预测）开始在生信领域火了

凌晨一点的秃头猪

论文阅读 GTI（Graph-based Tree Index）: 面向高维空间最近邻搜索的动态图-树混合索引结构这篇论文是 GTI: Graph-based Tree Index with Logarithm Updates for Nearest Neighbor Search in High-Dimensional Spaces，主题是：面向高维空间最近邻搜索的动态图-树混合索引结构。论文发表在 PVLDB，核心贡献是提出一种叫 GTI 的索引，用树结构降低构建和更新成本，用图结构保持高效搜索能力。

PTCMIL：基于提示 token 聚类的全切片图像多实例学习分析文献速递/多模态医学影像最新进展2026.6.16本文提出 PTCMIL，在 ViT 中用可学习提示 token 进行端到端、任务感知的切片内聚类与原型聚合，提升 WSI 分类、生存预测和跨域适应性能。

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06-16 · LLM 最新论文速览今日候选池 101 篇，硬过滤 + LLM 打分后通过评估 15 篇，精选 Top-10，另列 5 篇速览。

墨绿色的摆渡人

论文笔记（一百三十七）Learning Dual-Arm Push and Grasp Synergy in Dense Clutter引用：主页： https://sites.google.com/view/pg4da/home 原文： https://arxiv.org/pdf/2412.04052 代码、数据和视频： https://github.com/wyl1253/Learning-Dual-Arm-Push-and-Grasp-Synergy-in-Dense-Clutter

【第四十九周】论文阅读本周研读论文《DOCPRUNE: Efficient Document Question Answering via Background, Question, and Comprehension-aware Token Pruning》。该论文针对文档问答任务 Token 冗余、算力开销大的问题，提出无训练渐进式 Token 剪枝框架 DOCPRUNE。框架包含 BTP、QTP、CTP 三大模块，依次剔除背景、无关内容 Token，并依据模型分层理解能力自适应剪枝。实验表明，该方法在不微调模型的前提下，

Biomamba生信基地

NC | 单细胞分析揭示头颈部癌早期转移过程中潜在的免疫逃逸机制(R语言版本)文章《Single cell analysis in head and neck cancer reveals potential immune evasion mechanisms during early metastasis》（单细胞分析揭示头颈部癌早期转移过程中潜在的免疫逃逸机制），该文献发表于杂志《Nature Communications》，2023 年影响因子为 17.7。

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06-15 · LLM 最新论文速览今日候选池 89 篇，硬过滤 + LLM 打分后通过评估 7 篇。关注方向：多 Agent 系统 / LLM 后训练（RL/SFT） / 扩散语言模型 / 推理加速 / 长上下文 / 量化交易

小马哥crazymxm

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TRUST：RL 时保留模型的不确定性，效果提升 8%一句话介绍强化学习训练智能体的工具决策时，正确和错误决策都被训得同样自信，不确定性的区分能力被"抹平"了。TRUST 把不确定性量化直接写进奖励，当成一股排斥力，推开对错决策，让 4B 模型追平 Claude Sonnet 4

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06-11 · LLM 最新论文速览今日候选池 82 篇，硬过滤 + LLM 打分后通过评估 11 篇，精选 Top-10，另列 1 篇速览。

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空间图谱+注释工具= 《ADVANCED SCIENCE》六一新鲜发表的一篇《AS》，与一般的图谱类文章不同，本文的生物学意义立足于视网膜动脉阻塞（RAO），以我们教学过的SeekSpace和Stereo-seq为测试数据，开发了ASCAL（Automated Single-Cell Annotation and Localization）并构建了一个小鼠全眼单细胞空间图谱，精确绘制睫状体和视网膜上的细胞类型。关键结论：RAO模型中神经节细胞层（GCL）中显著的空间免疫激活，并通过免疫荧光染色进一步验证。

【文献笔记】Learn to Relax with LLMs: Solving COPs via Bidirectional CoevolutionLearn to Relax with Large Language Models: Solving Constraint Optimization Problems via Bidirectional Coevolution

论文阅读：Spatial Frequency Modulation Network for EﬃcientImage Dehazing作者： Hao Shen¹²³，Henghui Ding⁴，Yulun Zhang⁵，Zhong-Qiu Zhao³，Xudong Jiang⁶

Token Merging for Fast Stable Diffusion：一篇读懂 Stable Diffusion 的免训练加速机制欢迎大家关注Rocky的知乎：Rocky Ding AIGC算法工程师/开发工程师面试面经秘籍分享：WeThinkIn/Interview-for-Algorithm-Engineer欢迎大家Star～

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小红书提出 RedKnot：分头处理 kv 缓存，延时降低 60%效果还提升现有的 PIC 方案（位置无关 KV 缓存复用）实际加速效果并不明显，RedKnot 在注意力头粒度上复用和重算缓存，配合分层稀疏 FFN 和 SegPagedAttention，在答案质量不降的前提下，把首 token 延迟最高压到原来的约 1/3.5

【论文阅读】DATA SCALING LAWS IN IMITATION LEARNING FOR ROBOTIC MANIPULATION作者通过收集海量机器人操作数据，发现并验证了数据 scaling law，证明了只要收集足够多样的环境和物体数据，简单的模仿学习就能让机器人学会零样本泛化。

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06-10 · LLM 最新论文速览今日候选池 89 篇，硬过滤 + LLM 打分后通过评估 7 篇。关注方向：多 Agent 系统 / LLM 后训练（RL/SFT） / 扩散语言模型 / 推理加速 / 长上下文 / 量化交易

【论文阅读】WorldArena 2.0:扩展具身世界模型在模态性、功能性与平台上的基准测试通过把评测标准从“光看视频像不像”升级到“多模态感知+真动手干活+现实世界测试”，逼出真正能用的具身世界模型。