生物学

我的思维模型 -- 6.生物学篇能活下来的，不是最聪明的，而是最能适应环境变化的最好不要把自然选择的基本单位看作物种或者种群，甚至个体；最好把它看作遗传物质的某种小单位。为方便起见，简称为基因

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蛋白质质谱鉴定前样品制备注意事项蛋白质质谱鉴定前样品制备注意事项随着高分辨率质谱仪分析技术的发展，蛋白质质谱鉴定的方法已经相当纯熟，一次性鉴定多个蛋白样品，以及低丰度蛋白样品已经不再是难事。但是因为质谱的灵敏度高，外来引入的蛋白质可能会造成质谱鉴定的假阳性，因此，在蛋白样品的准备过程中要注意避免引入外来蛋白污染物。另外，蛋白样品的准备也需要使用与质谱仪检测兼容的溶液和试剂，这样可以极大提高质谱仪鉴定的准确度。在这期小编就来给大家介绍蛋白质质谱鉴定前的样品准备注意事项。

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蛋白质测序技术：揭示生命奥秘的关键工具蛋白质测序技术：揭示生命奥秘的关键工具蛋白质测序技术是用于确定蛋白质的氨基酸序列的关键技术。通过这一技术，科学家可以深入了解蛋白质的结构与功能关系，进而揭示其在细胞内的作用机制。蛋白质测序技术在包括医学、药物开发、生物技术等多个领域均有广泛的应用。特别是在疾病研究方面，蛋白质测序可以帮助识别疾病相关的蛋白质变异，为疾病的早期诊断和个性化治疗提供依据。此外，通过对特定蛋白质的测序，科学家能够设计出具有特定功能的蛋白质，推动生物工程的进步。蛋白质测序技术的发展始于20世纪50年代，当时Sanger法的出现标志

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易基因：PNAS：南方科技大学朱健康团队多组学揭示协同调控植物DNA甲基化与Polycomb沉默的表观遗传新机制大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2025年11月20日，南方科技大学朱健康院士团队在《Proc Natl Acad Sci U S A》（PNAS）杂志发表题为“A chromatin-linked CPL2–PHD2/3 module sustains multiple DNA methylation pathways and Polycomb silencing“的科研成果。研究揭示了植物中名为CPL2-PHD2/3的染色质关联功能模块通过协调多种DNA甲基化通路和Pol

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液相色谱-质谱（LC-MS）肽段分析液相色谱-质谱（LC-MS）肽段分析液相色谱-质谱（LC-MS）肽段分析是用于研究蛋白质的结构和功能的分析方法。这个技术结合了液相色谱的分离能力和质谱的检测能力，能够精确地识别和定量复杂样品中的肽段。液相色谱通过分离样品中的不同化合物，使得后续的质谱分析能够更清晰地识别每个肽段的特征。质谱仪是根据肽段的质荷比（m/z）来检测和识别其组成。通过这种方式，液相色谱-质谱（LC-MS）肽段分析可以提供关于蛋白质组分的详细信息，包括肽段的序列、修饰状态以及相对丰度。LC-MS肽段分析在生物医药、疾病研究、食品安全

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易基因：何川团队开发新m6A测序方法可温和条件下高分辨率/低背景噪声检测m6A修饰｜Nature子刊大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RNA和DNA中的化学修饰在多种生物过程中发挥着关键作用，包括转录调控、RNA降解、蛋白质翻译和免疫调节等。这些修饰已被新的测序方法以单碱基分辨率定量地绘制出来，其中核苷酸脱氨基是一种高效策略，用于选择性地绘制DNA中的5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine）和RNA中的N6-甲基腺苷（m6A）。然而，传统的化学脱氨基方法依赖于在苛刻的酸性条件下使用芳基重氮盐，这限制了其在大多数生物底物中的应用。近年来，基于亚硝酸盐离子的RNA测序方

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易基因特异性R-loop检测整体研究方案大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。R-loop是由DNA:RNA 杂交体和被置换的单链DNA组成的三链核酸结构，广泛参与基因转录、表观遗传调控及DNA修复等关键生物学过程。异常的R-loop积累会导致基因组不稳定性，与癌症、神经退行性疾病及自身免疫性疾病密切相关。

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易基因： ChIP-seq+DRIP-seq揭示AMPK通过调控H3K4me3沉积和R-loop形成以维持基因组稳定性和生殖细胞完整性｜NAR原文：ChIP-seq+DRIP-seq揭示AMPK通过调控H3K4me3沉积和R-loop形成以维持基因组稳定性和生殖细胞完整性｜NAR

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scRNA-seq scanpy教程1：准备工作+AnnData数据结构理解此处使用python版本的scRNA-seq处理工具scanpy，而不是R版本的seurat，因为seurat包安装繁杂

MATLAB和R及Python亚群差异表达分析在进行亚群差异表达分析以检测和分析选择性扰动效应时，MATLAB 可以通过一系列步骤来实现这一目的。以下是如何使用 MATLAB 进行这样的分析的简要步骤和示例。

MATLAB和Python及R聚类和亚群识别在 MATLAB 中进行聚类和亚群识别可以使用一些内置函数和工具箱，如 Statistics and Machine Learning Toolbox 和 Bioinformatics Toolbox。以下是如何使用 MATLAB 进行聚类和亚群识别的详细步骤，尤其是用于检测和分析选择性扰动效应。

MATLAB和Python及R潜变量模型和降维在 MATLAB 中，潜变量模型 (Latent Variable Models, LVMs) 和降维技术被广泛用于复杂数据的分析，例如基因表达数据或其他高维数据集。这些工具有助于揭示隐藏的结构并检测扰动（例如基因敲除或化学处理）在数据中的影响。以下是如何在 MATLAB 中使用这些技术来检测和分析选择性扰动效应的指南：

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易基因：Nat Commun：ATAC-seq等揭示恒河猴大脑高分辨率解剖区域的转录组和开放染色质图谱大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。恒河猴是神经科学研究中常用的模型动物，其大脑结构和功能与人类大脑相似。大脑中复杂的遗传网络是灵长类动物行为、认知和情感的基础，一直是神经科学的核心。大脑的综合转录组图谱是更深入地了解大脑功能的关键，这将有助于神经系统疾病研究。

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易基因：RNA修饰N4-乙酰胞苷（ac4C）的调控机制、检测方法及其在癌症中的作用最新研究进展｜新方向大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。N4-乙酰胞苷（ac4C）是一种高度保守的化学修饰，广泛存在于真核和原核生物RNA中，如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关，尤其是癌症，其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10（NAT10）（唯一已知ac4C的writer蛋白）的催化活性。本文讨论了ac4C的检测技术及其调控机制，并总结了ac4C与肿瘤发生、发展、预后和药物治疗的相关性。此外还对早期肿瘤诊断和预后预测的新生物标志物以及肿瘤治疗的新靶点进行了评论。

基于R语言lavaan结构方程模型（SEM）实践技术应用原文链接：基于R语言lavaan结构方程模型（SEM）实践技术应用https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzNTczMDMxMg==&mid=2247596681&idx=4&sn=08753dd4d3e7bc492d750c0f06bba1b2&chksm=fa823b6ecdf5b278ca0b94213391b5a222d1776743609cd3d14bfbddf2623795f0a8edadf4e6&token=1464653739&lang=zh_CN#rd一：

慢腾腾的小蜗牛

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R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图教程原文链接：R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图教程前沿R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。

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易基因：NAR：RCMS编辑系统在特定细胞RNA位点的靶向m5C甲基化和去甲基化研究｜项目文章喜讯！易基因表观转录组学RNA-BS技术服务见刊《核酸研究》大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。