【R语言】关联规则分析-应用于文献综述

关联规则分析-R语言

公式

  • Support 反映了特定变量组合在数据集中出现的频率。例如,如果特定变量 "A "在 30% 的实例中出现,则其支持度为 0.3:

support (Value a) =(number of transactions containing Value a) / (total number of transactions)

  • Confidence 衡量的是当一种情况(结果)出现时,另一种情况(前因)出现的可能性。如果 "A "之后经常出现 "B",那么 "A => B "这一规则的可信度就很高。

confidence (Value a ➞ Value b) =(support (Value a ∪Value b)) / (support (Value a))

  • Lift 通过比较观察到的 "A "和 "B "同时出现的频率与如果它们独立出现的预期频率,来评估关联的强度。提升值大于 1 表示有意义的关联,有正负区别:

Lift(A⇒B)=(Support(A∩B))/(Support(A)×Support(B))

  • Lift > 1:正向关联,前件的出现提升了后件的出现概率。Lift 越大,关联越强。
  • Lift = 1:无关联,前件和后件的出现是独立的,前件的出现并不会改变后件出现的概率。
  • Lift < 1:负向关联,前件的出现降低了后件的出现概率。)

数据准备

NO. col1 col2 ... Effect_Size_Direction

No.在数据包分析中会去除(目前是为了查数据方便才留在数据中的)

col均为数字编码

Effect_Size_Direction为1,0编码(1为正向,0为负向)

实现效果

Rules support confidence lift coverage
前件=>后件 前件后件同时出现的占比 前件成立的情况下后件成立的概率 与A、B为独立事件相比出现的可能性,反映AB的相关性 前件的占比

代码

r 复制代码
# 1. 安装并加载必要的包
#install.packages("readxl")  # 如果未安装,请运行这行
#install.packages("arules")  # 如果未安装,请运行这行
library(readxl)
library(arules)

# 2. 读取 Excel 文件
data <- read_excel("data.xlsx")

# 3. 删除不需要的列,例如 No. 列
data <- data[, -1]  # 删除第一列(ID列)
# 4. 确保所有的分类变量转换为因子
data$colname <- as.factor(data$colname)


### 5. 将 `Effect Size Direction` 作为后件(右侧)
rules_with_direction_as_rhs <- apriori(
  data, 
  parameter = list(support = 0.1, confidence = 0.9),
  appearance = list(rhs = c("Effect_Size_Direction=1", "Effect_Size_Direction=0"), default = "lhs")
)

# 查看生成的规则
inspect(rules_with_direction_as_rhs)

# 根据提升度筛选,只保留提升度大于 1 的规则
strong_rules_with_direction_as_rhs <- subset(rules_with_direction_as_rhs, lift > 1)
inspect(strong_rules_with_direction_as_rhs)

# 导出生成的规则到 CSV 文件
write(rules_with_direction_as_rhs, file = "rules_with_direction_as_rhs.csv", sep = ",", quote = TRUE, row.names = FALSE)

write(strong_rules_with_direction_as_rhs, file = "strong_rules_with_direction_as_rhs.csv", sep = ",", quote = TRUE, row.names = FALSE)
相关推荐
开开心心就好17 小时前
系统管理工具,多功能隐私清理文件粉碎工具
java·网络·windows·r语言·电脑·excel·symfony
kisshuan1239620 小时前
【植物图像分析系列】:基于Cascade R-CNN的叶片气孔状态识别与分类任务详解_1
分类·r语言·cnn
Tiger Z4 天前
《R for Data Science (2e)》免费中文翻译 (第17章) --- Dates and times(1)
r语言·编程·数据科学
杜子不疼.4 天前
计算机视觉热门模型手册:Faster R-CNN / YOLO / SAM 技术原理 + 应用场景对比
人工智能·计算机视觉·r语言·cnn
Davina_yu4 天前
Windows 下升级 R 语言至最新版
开发语言·windows·r语言
青春不败 177-3266-05205 天前
基于R语言生物信息学大数据分析与绘图技术应用
数据分析·r语言·生物信息·生信·高通量
Catherinemin5 天前
【R语言】2.注释&基础运算
开发语言·r语言
邢博士谈科教5 天前
TCGA单基因高低分组的差异分析后的GSEA-GO和KEGG富集分析教程
数据分析·r语言
Catherinemin6 天前
【R语言】1.安装&基础语法
开发语言·r语言
Tiger Z6 天前
R 语言科研绘图 --- 3D绘图-汇总1
r语言·论文·科研·绘图·研究生