R语言6种将字符转成数字的方法,写在新年来临之际

咱们临床研究中,拿到数据后首先要对数据进行清洗,把数据变成咱们想要的格式,才能进行下一步分析,其中数据中的字符转成数字是个重要的内容,因为字符中常含有特殊符号,不利于分析,转成数字后才能更好进行分析。

今天来总结一下常见的几种字符转数字的方法,建议收藏,以后需要用时找得到。咱们先生成一个数据,来示例一下。

r 复制代码
library(tidyr)

# 创建原始宽格式的数据框
data <- data.frame(
  id = c(1:8),
  group = c(0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1),
  w0 = c(0.35, 0.77, 0.48, 0.63, 0.45, 0.56, 1.08, 0.55),
  w1 = c(1.01, 1.32, 1.18, 1.42, 0.59, 0.86, 1.44, 1.20),
  w2 = c(1.47, 1.60, 1.65, 1.88, 0.64, 1.37, 1.93, 1.68),
  w4 = c(2.46, 2.54, 2.86, 3.13, 0.99, 2.04, 2.63, 2.87)
)

# 将数据框从宽格式转换为长格式
df_long <- data %>%
  pivot_longer(
    cols = c('w0', 'w1', 'w2', 'w4'), # 需要转换的列名
    names_to = "time",                # 新生成的列名,用来存储原列名
    values_to = "value"               # 新生成的列名,用来存储原数值
  )

好的,数据生成了,我们看到到time这一列的变量是w0,w1,w2,w4的字符变量,咱们想要把它转成数字0,1,2,4,应该怎么转换呢?最常见的时候是想起ifelse()函数来一个个的转换,但是这样效率太低了,介绍几种快速转换的。

  1. dplyr包
r 复制代码
library(dplyr)
df_long2 <- df_long %>%
  mutate(time = case_when(
    time == "w0" ~ 0,
    time == "w1" ~ 1,
    time == "w2" ~ 2,
    time == "w4" ~ 4,
    TRUE ~ as.numeric(time) # 这一行确保如果未来有其他值,它们不会变成NA
  ))

这样就轻松转换好了。

  1. 也是继续使用dplyr包recode()函数,咱们注意一下,这两个函数的判断方法有点不一样。等号前面不能有空格。
r 复制代码
library(dplyr)
df_long3 <- df_long %>%
  mutate(time = recode(time, w0 =0, w1 =1, w2 =2, w4 =4))
  1. 使用基础R中的 factor() 和 as.numeric(),这个的好处是不用在额外使用R包,但是你必须一个个的指定。也要对基础语法比较掌握。
r 复制代码
df_long3$time2 <- as.numeric(as.character(factor(df_long$time, 
                                               levels = c("w0", "w1", "w2", "w4"),
                                               labels = c(0, 1, 2, 4))))
  1. stringr包来对数字提取,因为咱们是字符后面的数字部分,所以可以用这样的方法,并不适合所有情况。
r 复制代码
library(stringr)
df_long4 <- df_long %>%
  mutate(time = as.numeric(str_extract(time, "\\d+")))
  1. 使用dplyr包的if_else函数,注意一下这个和基础的ifelse()函数是不一样的
r 复制代码
df_long5<- df_long %>%
  mutate(time = if_else(time == "w0", 0,
                        if_else(time == "w1", 1,
                                if_else(time == "w2", 2,
                                        if_else(time == "w4", 4, NA_real_)))))
  1. 因为它是位置索引,所以索引回来的是位置,因此有个小缺点,4变成了3,不能完全满意。为什么我还要说呢,使用 match() 函数,这个函数主要是用来索引字符匹配的。明白它的用法在很多地方都能有很大的用途。
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df_long6 <- df_long %>%
  mutate(time = match(time, c("w0", "w1", "w2", "w4")) - 1) # 因为索引从1开始,所以减去1

写在新年来临之际,公众号4年来有无数的铁粉默默支持,给我提了很多好的意见,受益良多,在此默默感谢。

新的一年公众号会将对纵向分析进行一些介绍,包括混合效应模型、gee模型、gamm模型等。也会继续复现一些关于charls的纵向分析文章。

感谢大家对我的scitable包的支持,有些粉丝还不明白它能做什么,最基础的功能就是:基线表、单因素和多因素分析,多模型分析,阈值效应分析,亚组分析,rcs分析。还可以进行数据挖掘和交互效应深层次数据挖掘。

目前还有很多功能待写,比如一键相加交互模型函数、gamm模型函数、gam模型的阈值函数、gee模型的曲线拟合和阈值函数,新版的亚组森林图,相信不会让你们失望的。

最后祝各位粉丝新年快乐,合家美满,连发连中。

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