Ubuntu 20.04使用MB-System分析与可视化EM3000数据

Ubuntu 20.04使用MB-System分析与可视化EM3000数据

文章目录

• • [Ubuntu 20.04使用MB-System分析与可视化EM3000数据](#Ubuntu 20.04使用MB-System分析与可视化EM3000数据)
  • 1) 安装依赖（Ubuntu 20.04） 安装依赖（Ubuntu 20.04）)
  • 2) 获取 MB-System 源码 获取 MB-System 源码)
  • • [方式 A：直接 clone](#方式 A：直接 clone)
    • [方式 B：下载 release 源码包](#方式 B：下载 release 源码包)
  • 3) CMake 构建 & 安装 CMake 构建 & 安装)
  • 4) 环境变量 环境变量)
  • 5) 参数文档 参数文档)
  • 6) 可视化 可视化)

• https://github.com/dwcaress/MB-System

• https://www.mbari.org/technology/mb-system/installation/

• https://www.mbari.org/technology/mb-system/documentation/data-format-specifications/

• https://github.com/dwcaress/MB-System/issues/320

• https://support.echoview.com/WebHelp/Reference/File_Formats/Kongsberg_data_files.htm

首先我们获得了.all的EM3000多波束声呐的数据，但是没有具体的解析工具，通过检索发现了MB的F56包含EM3000这个设备

    MBIO Data Format ID:  56
    Format name:          MBF_EM300RAW
    Informal Description: Simrad current multibeam vendor format
    Attributes:           Simrad EM120, EM300, EM1002, EM3000,
                          bathymetry, amplitude, and sidescan,
                          up to 254 beams, variable pixels, ascii + binary, Simrad.

我们注意到这个Format name: MBF_EM300RAW包含了我们需要的设备EM3000

MB-System 中编号为 56 的格式（MBF_EM300RAW）是 Simrad/Kongsberg 厂商使用的多波束原始数据格式，适用于 EM120 / EM300 / EM1002 / ✅ EM3000，包含水深、回波强度、侧扫数据，每 ping 最多 254 波束，数据结构是 ASCII + 二进制混合。

下面开始构建这个**MB-System**，安装教程可以访问https://www.mbari.org/technology/mb-system/installation/

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1) 安装依赖（Ubuntu 20.04）

sudo apt update
sudo apt upgrade -y
sudo apt install -y build-essential

# MB-System prerequisites（MBARI 官方给的 20.04/22.04/24.04 依赖清单）
sudo apt install -y libtirpc-dev \
  netcdf-bin libnetcdf-dev libgdal-dev \
  gmt libgmt6 libgmt-dev libproj-dev \
  libfftw3-bin libfftw3-dev libmotif-dev \
  xfonts-100dpi libglu1-mesa-dev \
  libopencv-dev cmake gfortran

官方还提示：装完依赖后注销/重新登录一次，让 X11 字体等资源正确加载。

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2) 获取 MB-System 源码

方式 A：直接 clone

cd ~
git clone https://github.com/dwcaress/MB-System.git
cd MB-System

• https://github.com/dwcaress/MB-System

方式 B：下载 release 源码包

去 release 页面下 tar.gz/zip（官方给了 releases 入口），下载后示例（用你实际版本号替换）

本文以目前最新版本5.8.2为例

• https://github.com/dwcaress/MB-System/releases/tag/MB-System-5.8.2

sudo mkdir -p ~/MB-System-src
sudo mv MB-System-MB-System-5.8.2.tar.gz ~/MB-System-src
cd ~/MB-System-src
sudo tar xvzf MB-System-MB-System-5.8.2.tar.gz
cd MB-System-MB-System-5.8.2

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3) CMake 构建 & 安装

在源码顶层创建 build 目录并编译安装：

sudo mkdir -p build
cd build
sudo cmake ..
sudo make -j"$(nproc)"
sudo make install

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4) 环境变量

官方说明默认会装到 /usr/local/bin，把它加入 PATH：(MBARI)

echo 'export PATH=/usr/local/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

验证安装是否成功

mbinfo -V

Program MBINFO
MB-system Version 5.8.2

MBIO Error returned from function <mb_read_init>:
Illegal format identifier, initialization failed

Swath File <stdin> not initialized for reading

Program <MBINFO> Terminated

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5) 参数文档

• https://www3.mbari.org/products/mbsystem/html/mbsystem_man_list.html

在这个网页中包含了一些常见的命令和参数

本文以mbinfo为例，其余类似

• https://www3.mbari.org/products/mbsystem/html/mbinfo.html

-I filename 指定输入文件
-F format 我们是EM3000对应的是.all → 58 -F58
-N 输出记录
-O 生成 *.inf文件 后面可视化需要

mbinfo -F58 -I 0001_20160903_020128_raw.all -O

6) 可视化

MB-System 的一些图形化工具依赖 X11/Motif/OpenGL；Ubuntu 20.04 依赖里已经包含了 libmotif-dev、libglu1-mesa-dev 等（这是 MBARI 依赖清单的一部分）

mbinfo -F58 -I 0001_20160903_020128_raw.all -O

在上一步的-N的内容是生成0001_20160903_020128_raw.all.inf，用于可视化

mbeditviz -F58 -I 0001_20160903_020128_raw.all