卡梅德生物技术快报|SPR 技术应用|基于 SPR 亲和力的中药活性成分筛选系统实现与数据分析

摘要

表面等离子共振(SPR)是生物分子互作分析的核心技术,本文以连翘活性成分筛选为案例,详细讲解SPR 亲和力筛选的实验搭建、芯片偶联、垂钓富集、液质鉴定、分子模拟、动力学拟合全流程,给出可工程化复现的技术方案,适合生物信息、生物工程、药物研发工程师参考。

1 技术背景

在中药复杂体系中,传统活性筛选方法存在纯化繁琐、标记干扰、假阳性高、无法定量等问题。SPR 无标记互作技术可直接在粗提体系中实现活性成分垂钓,并定量检测亲和力(KD)、结合速率(ka)、解离速率(kd) ,为活性成分筛选提供客观量化指标,已成为药物研发的关键底层技术。

2 SPR 实验系统搭建

2.1 芯片与蛋白偶联

选用 CM5 传感芯片,采用氨基偶联流程:1)EDC/NHS 混合液以 10 μL/min 流速激活芯片通道;2)靶蛋白用 pH 4.0 醋酸钠稀释至 50 μg/mL,固定至芯片表面;3)乙醇胺封闭未反应位点,完成蛋白固载;4)同步构建参比通道,消除非特异性结合干扰。本实验蛋白偶联量达 8941 RU,满足后续垂钓与亲和力检测要求。

2.2 样品制备与 SPR 垂钓

称取连翘药材,水提后制成 500 mg/mL 浓缩液,经滤膜除菌后,稀释为 500、250、125 mg/mL 梯度浓度。样品以 10 μL/min 流速进样,结合 60 s,解离 60 s,重复检测,收集特异性结合洗脱液。结果显示:RU 信号随样品浓度升高而增强,呈现典型浓度依赖性结合,证明体系存在特异性互作成分。

3 活性成分质谱鉴定

将 SPR 垂钓洗脱液经甲醇复溶、超声、离心、过滤后,采用 Q Exactive Plus 高分辨液质联用仪检测,正负离子模式同时扫描,通过 Compound Discover 3.2 软件进行峰提取与结构鉴定。共鉴定出 9 种活性成分:原儿茶酸、马钱苷酸、红景天苷、断氧化马钱苷、连翘酯苷 I、毛蕊花糖苷、茵芋苷、异连翘酯苷 A、桑黄素。

4 分子水平结合验证

4.1 分子对接

对靶蛋白进行同源建模与去水优化,小分子配体进行能量最小化处理,采用 AutoDock Vina 进行对接,计算结合亲和力。筛选结合能<-5.0 kcal/mol 的成分进入下一步模拟。

4.2 分子动力学模拟

采用 AMBER 22 进行 100 ns 模拟,蛋白用 ff14SB 力场,小分子用 gaff 力场,TIP3P 水盒子构建体系。计算 RMSD 与 MM-GBSA 结合自由能,结果显示:毛蕊花糖苷、异连翘酯苷 A、桑黄素结合自由能<-10 kcal/mol,体系稳定。

5 SPR 亲和力定量检测(核心环节)

5.1 单点筛选

将 9 种候选成分配制成 100 μmol/L 初始浓度,进样检测结合信号。结果显示:所有成分均产生特异性结合信号,毛蕊花糖苷、原儿茶酸信号幅值最高,优先进入定量检测。

5.2 动力学与亲和力拟合

将毛蕊花糖苷倍比稀释为 0.1875~12 μmol/L 梯度浓度,以 30 μL/min 流速进样,采集结合 / 解离曲线。使用 Biacore T200 evaluation 软件,采用1:1 Langmuir 结合模型全局拟合,得到 KD=3.24×10⁻⁶ M,证明毛蕊花糖苷与靶蛋白具有高强度亲和力。

6 技术优势与工程化价值

1)无标记原位检测 :直接在粗提体系筛选,无需纯化,适配中药复杂样品;2)定量亲和力输出 :提供 KD、ka、kd 等关键参数,为药物筛选提供量化依据;3)高通量高效 :单次可完成多组分、多浓度检测,大幅缩短研发周期;4)结果可靠:结合分子模拟与体内验证,降低假阳性。

7 总结

基于 SPR 亲和力的中药活性成分筛选体系,将生物传感、质谱鉴定、计算模拟、功能验证有机结合,形成标准化、可复现、可量化的研发流程。该方案可直接迁移至天然产物筛选、小分子互作、蛋白靶标验证等场景,是生物工程与药物研发领域的高价值技术方案。

参考文献:王琳,王平,蔡雯等。基于 SPR 垂钓技术的连翘靶向 RSV-F 蛋白 "功效物质" 筛选 J. 世界科学技术 - 中医药现代化,2025,27 (05):1405-1416.

相关推荐
海清河晏11120 小时前
字符串匹配:BF算法与KMP算法
数据结构·算法·visual studio
wandertp20 小时前
对信号处理及滤波器的理解---基于robomaster机器人嵌入式控制系统
arm开发·stm32·算法·信号处理
z小猫不吃鱼20 小时前
15 InstructGPT 论文精读:SFT + RLHF 如何让模型听懂指令?
人工智能·深度学习·算法·机器学习·语言模型·自然语言处理·gpt-3
见合八方20 小时前
【滤波器】热调谐FP滤波器
人工智能·算法
古城小栈20 小时前
cargo-pprof:Rust性能调优
人工智能·算法·rust
x_xbx20 小时前
LeetCode:543. 二叉树的直径
算法·leetcode·职场和发展
QiLinkOS20 小时前
QiLink 技术委员会选举实施细则
c语言·数据结构·c++·单片机·嵌入式硬件·算法·开源
我材不敲代码20 小时前
Python基础: 函数超全详解:定义、参数、返回值、作用域与递归
开发语言·python·算法
罗超驿20 小时前
11.LeetCode 1004. 最大连续1的个数 III | 滑动窗口解法详解(Java)
java·算法·leetcode
努力发光的程序员21 小时前
面试官与程序员谢飞机的3轮Java大厂面试问答实录:涵盖Spring Boot、微服务与数据库技术
java·jvm·spring boot·redis·面试·hibernate·microservices