RACE技术全攻略:从全长克隆到靶基因验证

一、长链非编码RNA的全长克隆

长链非编码RNA(lncRNA)是指转录本长度超过200个核苷酸的RNA分子,本身不编码蛋白质,而是以RNA形式在表观遗传调控、转录调控及转录后调控等多个层面发挥基因表达调节功能。

当前公共数据库中收录的许多lncRNA序列存在两端信息不完整或准确性不足的问题,直接限制了后续功能实验的开展。针对这一痛点,科沿有道在lncRNA全长克隆领域积累了扎实的技术经验,能够有效保证所克隆序列的完整性和准确性,为下游研究提供可靠的数据支撑。

二、microRNA靶基因验证:RLM-RACE技术

利用Invitrogen公司的FirstChoice® RLM-RACE Kit试剂盒,通过5′ RLM-RACE实验可对microRNA与其靶基因之间的剪切调控关系进行验证,并能精确定位剪切位点。该实验是microRNA功能研究中的关键环节,为深入解析microRNA的调控机制提供直接证据。

三、常规基因RACE克隆

针对常规基因的RACE克隆服务,采用成熟的RACE技术体系,确保目标基因序列的完整性和准确性。此类实验周期通常为15-20个工作日,可满足绝大多数基因克隆需求。

四、实验材料要求与注意事项

为确保RACE实验的顺利进行和结果的可靠性,送样时需特别注意以下事项:

1. 样品的采集与保存

提取Total RNA的样品必须保证新鲜。采样后应立即投入液氮速冻,或及时加入样品稳定剂进行处理,以防RNA降解。

2. RNA质量要求

Total RNA应无降解迹象,OD260/280比值需在1.8-2.0之间,以确保纯度符合实验要求。

3. 样品起始量

为保证成功率,建议提供充足的起始材料:

  • 3′ RACE:Total RNA > 15 μg

  • 5′ RACE:Total RNA > 25 μg

    若目标基因表达丰度较低或待克隆序列较长,应酌情增加样品量。

4. 低丰度基因的处理策略

当验证结果表明样品中目标基因的表达水平偏低时,我司将与客户沟通协商,共同确定后续实验方案(如富集策略或方法调整),以最大程度保证结果产出。

5. 测序结果的说明

由于不同个体或组织来源的mRNA存在序列多态性,且部分基因区域可能存在特殊二级结构或高GC含量,RACE产物的测序结果有时可能出现个别碱基套峰或部分区段无法读通的情况。对于未测通区域,我们将继续通过克隆测序的方式进行补充,最终提供两个独立质粒的测序结果。序列中个别碱基的最终确认,需由客户结合自有序列信息进行综合判断。

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