【文献分享】SpatialZ弥合从平面空间转录组学到三维细胞图谱之间的维度差距空间转录组学(ST)极大地改变了我们对组织结构的理解,但构建全面的三维(3D)细胞图谱仍面临技术限制和高昂成本的挑战。目前的方法通常只能捕获稀疏采样的二维切片,留下了大量空白区域,限制了我们对连续器官组织结构的理解。在此,我们提出了 SpatialZ,这是一个计算框架,通过在实验测量的切片之间生成虚拟切片来填补这些空白,从而能够从平面 ST 数据中构建密集的 3D 细胞图谱。SpatialZ 旨在以单细胞分辨率运行,并且不受特定空间技术固有的基因覆盖限制的影响。全面的验证表明,SpatialZ 能准确地保