R包的查看、卸除、安装与卸载

01. 卸载自己古老的包

查看自己的包

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mypackages <- installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')] %>% as.data.frame()
write.csv(mypackages, "~/Desktop/mypackages.csv")

从存的文档中找到自己想要卸载的R包

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remove.packages(c("BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9", "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19", "GenomeInfoDb", "GenomeInfoDbData", "GenomicAlignments", "GenomicFeatures", "GenomicRanges", "GO.db", "GSEABase", "KEGGgraph", "KEGGREST", "learnr", "RgoogleMaps", "RSQLite", "yeastRNASeq", "yyplot"), lib = .libPaths()[1])
remove.packages(c("IRdisplay", "IRkernel"), lib = .libPaths()[2])

mypackages <- installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')] %>% as.data.frame()
write.csv(mypackages, "~/Desktop/mypackages_new.csv")

查看之后上述的包已经被卸载了。

02. 补充部分

查看已加载的包

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(.packages())

卸除已加载的包

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detach("package:RMySQL")

注意是卸除,不是卸载,也就是说不是把包从R运行环境中彻底删除,只是不希望该包被加载使用。

在包使用函数冲突,检验函数依赖时比较有用。

安装包

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install.packages("TSA")

列出包所在库的路径

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.libPaths()

包的载入

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library() 或 require()

安装完包后,需要加载才能使用其中的函数,此时括号中不使用引号。两者的不同之处在于library()载入之后不返回任何信息,而require()载入后则会返回TRUE,因此require()适合用于程序的书写。

包的更新

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update.packages()

彻底删除已安装的包:

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remove. packages(c("pkg1","pkg2") , lib = file.path("path", "to", "library"))

查看已安装的包

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installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')]

其中c('Package','Version','LibPath') 表示显示包名、版本、库路径信息,若无[,c('Package','Version','LibPath')]参数,则显示所有信息。

查看某个包提供的函数

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help(package='TSA')

作者:LeoinUSA

链接:https://www.jianshu.com/p/6358091a5683

来源:简书

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