深度学习| U-Net网络

U-Net网络

基础知识

理解U-Net网络结构需要相关知识点。

和CNN的关系

U-Net也是CNN(Convolutional Neural Network,卷积神经网络)的一种,所以也会涉及CNN的原理。关于CNN的一些内容,在之前的一篇文章介绍过"深度学习|CNN卷积神经网络",这边就简单再说一下CNN原理中的"卷积、池化、全连接",因为这些在后面U-Net结构理解的时候会用到。

卷积:主要作用是提取特征,通过一个过滤器/卷积核来过滤图像各个小区域,从而得到各个小区域的特征。

池化:提取某个区域的总结特征,主要作用是下采样(Downsampling),能够数据降维,但是不会损坏识别结果。

全连接:主要作用是分类。通过卷积层和池化层的出来的特征,需要让全连接层对前面总结好的特征做分类判断。

不过U-Net网络,全是卷积和池化层,没有全连接层。

反卷积

卷积后,通常有3种结果:

  1. valid卷积:结果图比原图小。
  2. same卷积:结果图和原图一样大。
  3. full卷积:结果图比原图大。

而其中的full卷积,就是反卷积又叫做上采样。关于以上三种卷积是如何形成,主要是源于在做卷积的时候,原图进行扩大的程度。

valid卷积:结果图比原图小。卷积的时候不对原图进行扩展或者扩展比较小。

same卷积:结果图和原图一样大。卷积的时候扩展一下原图,例如上面3×3的卷积,不做扩展导致每次边缘的像素点都没成为过卷积的中心像素,只需要对原图扩展一下就能包含边缘像素,从而实现same卷积。这种扩展操作,通常叫做padding。

full卷积:结果图比原图大。卷积的时候把原图比same卷积更大比例补0扩展。

ReLU激活函数

激活函数:神经网络中,每个节点代表一种特定输出函数,负责将神经元的输入映射到输出端。通常称为激活函数。

为什么要引入非线性激活函数:激活函数全用线性的,那样无论神经网络有多少层,输出都是输入线性组合,和没有隐藏层的效果差不多了。引入非线性函数作为激活函数,这样深层神经网络才有了意义,不再是输入的线性组合,而是可以逼近任意函数,更好拟合复杂的数据。另外,神经网络本身就是模拟生物神经元,生物神经元的行为本来就是非线性的。

ReLU函数的表达式:
f ( x ) = m a x ( 0 , x ) f(x)=max(0,x) f(x)=max(0,x)

从表达式看ReLU函数实际就是把大于0的数保留,小于0的数直接清零。

为什么使用ReLU激活函数:

  • ReLU没有复杂的运算,计算简单高效,收敛速度也快。 Sigmoid等函数,算激活函数和反向传播求误差梯度时,涉及到指数、求导、除法等运算,计算量大。
  • ReLU函数没有饱和区,不存在梯度消失问题。Sigmoid接近包和区时候,变换太慢,导数趋于0,而产生信梯度消失的情况,导致无法完成深层网络训练。
  • ReLU使得一部分神经元输出为0,造成了网络的稀疏性,减少了参数之间相互依赖关系,一定程度上缓解了过拟合问题。

ReLU缺点:学习率过大的时候,可能造成大部分神经元清零。

补充:经典的Sigmoid函数,其表达式为 σ ( x ) = 1 / ( 1 + e − x ) \sigma(x)=1/(1+e^{-x}) σ(x)=1/(1+e−x),能够把值映射到0~1。

U-Net入门

U-Net网络结构图

从上面的网络结构图来看,就知道为什么是U-Net了,网络结构就是一个U型。经典的编码器解码器结构,左边部分是编码器,右边部分是解码器。左边部分又被称为收缩路径 ,右边又被称为扩展路径 ,中间同一个曾灰色的箭头线被称为跳跃连接(Skip Connection)。

图中不同颜色箭头的解释:

  1. 蓝紫箭头:3×3卷积核做卷积,再用ReLU激活函数输出特征通道。
  2. 灰色箭头:进行裁剪和复制。
  3. 红色箭头:2×2池化核进行最大池化/下采样。
  4. 绿色箭头:2×2卷积核做反卷积/上采样
  5. 青蓝箭头:1×1卷积核做卷积。

对上图结构部分做详细解释,其它部分可以自己参考详细解释来理解:

  • 最左上角处理:输入图片大小为572×572,经过64个3×3的卷积核进行卷积,再通过ReLU函数后得到64个570×570的特征通道。把这570×570×64的结果再经过64个3×3的卷积核进行卷积,同样通过ReLU函数后得到64个568×568的特征提取结果。这就是第一层的处理,然后通过2×2的池化核,对图片下采样为原来大小的一半284×284×64。把284×284×64的结果,经过128个3×3×64的卷积核进行卷积,得到282×282×128(这部分实际上是对284×284×64全部做128个卷积)。
  • 最右上角处理:392×392×128白蓝框来源于两个部分,蓝色部分是下面一层上采样/反卷积,196×196×128通过64个2×2卷积核反卷积,得到392×392×64;白色部分是同一层复制裁剪得到的,左边568×568×64结果复制再裁剪,得到392×392×64。蓝紫色箭头的过程不再多做解释,和"最左上角处理"介绍的是一样的。最右边最后一个青蓝箭头变换,388×388×64通过2个1×1的卷积核,得到388×388×2。

为什么需要跳跃连接

  1. 反卷积只能扩大图片,不能还原图片,为了减少数据丢失,通过跳跃连接把同一层下采样的图片裁剪相同大小后增加特征层。大小不一致需要裁剪,主要是因为每次卷积都会丢失边界像素。
  2. 结合深层信息和浅层信息,深层信息就是经过多次下采样后的低分辨率信息,能够提供分割目标在整个图片像素中上下文语义西悉尼,可以理解为特征,有助于物体的分类;浅层信息,通过跳跃连接从编码器传递到解码器上的高分辨率信息,能够给分割提供更加精细的特征。

U-Net的输入

由于不断valid卷积,边缘信息不够,卷积后图片越来越小,最终得到输出是会比输入要小的。为了保证操作后结果和原图大小一致,在输入前都会图片进行镜像扩展操作。

另外原作还用了Overlap-tile策略。医学图像通常都很大,不可能把原图输入网络,所以会进行切片,为了图片拼接部分分割更准确,采用了Overlap-tile策略,就是切片之间会有重叠。

上面这张原图就做了镜像扩充,做了切片裁剪,输入蓝色部分图片通过U-Net最后能得到黄色有效区域处理结果。而Overlap-tile的切片重叠,应该指的是蓝色框会重叠。

U-Net的应用

主要解决的是医学领域的图像分割问题,目前基模型及其变种广泛应用于医学生物图像分割。

为什么适用于医学图像分割:

  • 医学图像由于涉及病人隐私以及难获取等问题,数据相对较少,U-Net使用了丰富数据增强策略来扩充数据集,例如随机旋转、翻转、缩放等,可以提高模型的泛化能力和鲁棒性。
  • U-Net模型是轻量级网络,参数量少,不容易过拟合,训练速度快。
  • U-Net支持多通道多模态的医学图像输入,能够充分利用不同模态之间信息。多模态,例如MRI图像可能包含T1、T2、FLAIR等通道。
  • 医学图像本身语义的信息就比较简单,结构比较谷顶。医学图像的信息密度远远不及平时拍的照片,应用场景也比较针对性,要做眼底就用眼底OCT,要做脑就用脑CT和脑MRI,都是针对固定的器官成像。所以高级语义信息和低级特征都显得很重要,U-Net的跳跃连接就排上用场了,就是结构图中灰色的箭头,结合低分辨率(提供物体类别标识的依据)和高分辨率信息(提供精确分割定位依据)。
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