Python手册(Machine Learning)--XGBoost

title: Python(Machine Learning)--XGBoost

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Python
机器学习
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Python
Machine Learning
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abbrlink: c46d5dae
date: 2024-01-25 22:15:00
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Quick Start

XGBoost本质上还是一个GBDT，但是力争把速度和效率发挥到极致，所以叫 Extreme Gradient Boosting。XGBoost高效地实现了GBDT算法，并进行了算法和工程上的许多改进，被广泛应用在Kaggle竞赛及其他许多机器学习竞赛中，并取得了不错的成绩。

而在实际建模环节，XGBoost提供了Sklearn API和原生API两套调用方法。大部分时候我们使用原生代码来运行xgboost，因为这套原生代码是完全为集成学习所设计的，不仅可以无缝使用交叉验证、默认输出指标为RMSE，还能够默认输出训练集上的结果帮我们监控模型。

首先，原生代码必须使用XGBoost自定义的数据结构DMatrix，这一数据结构能够保证xgboost算法运行更快，并且能够自然迁移到GPU上运行。
当设置好数据结构后，我们需要以字典形式设置参数。XGBoost也可以接受像sklearn一样，将所有参数都写在训练所用的类当中，然而由于xgboost的参数列表过长、参数类型过多，直接将所有参数混写在训练模型的类中会显得代码冗长且混乱，因此我们往往会使用字典单独呈现参数。
准备好参数列表后，我们将使用xgboost中自带的方法xgb.train或xgb.cv进行训练，训练完毕后，我们可以使用predict方法对结果进行预测。虽然xgboost原生代码库所使用的数据结构是DMatrix，但在预测试输出的数据结构却是普通的数组，因此可以直接使用sklearn中的评估指标，或者python编写的评估指标进行评估。

数据结构	说明
`xgboost.DMatrix`	XGBoost数据集
`xgboost.DataIter`	迭代数据
`xgboost.QuantileDMatrix`	直接为hist方法生成分位数数据
`xgboost.Booster`	XGBoost中的返回的模型

python 复制代码

xgboost.DMatrix(data, 
                label=None, 
                weight=None, 
                base_margin=None, 
                missing=None, 
                silent=False, 
                feature_names=None, 
                feature_types=None, 
                nthread=None, 
                group=None, 
                qid=None, 
                label_lower_bound=None, 
                label_upper_bound=None, 
                feature_weights=None, 
                enable_categorical=False, 
                data_split_mode=DataSplitMode.ROW)

常用参数：

data 内部数据集的数据源
label 数据标签
weight 每个样本的权重
feature_names 特征名称
feature_types 数据类型。如果设置 enable_categorical=False，字符"c"代表分类数据，字符 "q"代表数值型数据。
feature_weights - Set feature weights for column sampling.
enable_categorical 允许分类特征

现在，我们来简单看看原生代码是如何实现的。

Step 1: Load the dataset

DMatrix会将特征矩阵与标签打包在同一个对象中，且一次只能转换一组数据。并且，我们无法通过索引或循环查看内部的内容，一旦数据被转换为DMatrix，就难以调用或修改了。

因此，数据预处理需要在转换为DMatrix之前做好。如果我们有划分训练集和测试集，则需要分别将训练集和测试集转换为DMatrix。

python 复制代码

# load or create your dataset
import xgboost as xgb
from sklearn.datasets import load_boston
from sklearn.model_selection import train_test_split

X, y = load_boston(return_X_y=True)
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3)

# create DMatrix for xgboost
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train)
dtest = xgb.DMatrix(X_test, y_test)

# specify validations set to watch performance
watchlist = [(dtest, "eval"), (dtrain, "train")]

对于表示分类要素的所有列。之后，用户可以告诉 XGBoost 启用使用分类数据进行训练。假设您正在使用 for 分类问题，请指定参数：enable_categorical

XGBoost 可以直接支持分类特征，而不需要 one-hot 编码。传递分类数据最简单方法是使用 dataframe ，将数据类型指定为 category。

python 复制代码

# We need to specify the data type of input  as category.
X["cat_feature"].astype("category")

之后通过指定参数 enable_categorical=True 来启用分类数据进行训练

python 复制代码

# Specify `enable_categorical` to True
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train, enable_categorical=True)

booster = xgb.train({"tree_method": "hist", "max_cat_to_onehot": 5}, Xy)
# Must use JSON for serialization, otherwise the information is lost
booster.save_model("categorical-model.json")

Note: 在构建 DMatrix 前，先把分类特征转换成整数型。

对于其他类型的输入，例如 numpy/cupy array，我们可以通过 feature_types 参数设置分类特征。"q" 或 "float" 代表数值型特征，"c"代表分类特征。

python 复制代码

#  "q" is numerical feature, while "c" is categorical feature
ft = ["q", "c", "c"]
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train, feature_types=ft, enable_categorical=True)

Step 2: Setting Parameters

python 复制代码

# specify parameters via map
param = {'booster': 'dart',
         'max_depth': 5, 
         'learning_rate': 0.1,
         'objective': 'binary:logistic',
         'sample_type': 'uniform',
         'normalize_type': 'tree',
         'rate_drop': 0.1,
         'skip_drop': 0.5}

# You can also specify multiple eval metrics:
params['eval_metric'] =  ['error', 'rmse']

Step 3: Training

python 复制代码

# Training a model requires a parameter list and data set:
evals_result = {}
bst = xgb.train(params,
                dtrain,
                num_boost_round=20,
                evals=watchlist,
                evals_result = evals_result，
                early_stopping_rounds=10)

# Training with 5-fold CV:
xgb.cv(params, dtrain, num_boost_round=20, nfold=5)

不难发现，XGBoost不需要实例化，xgb.train函数包揽了实例化和训练的功能，一行代码解决所有问题。

Step 4: Save and load model

python 复制代码

# Save model
bst.save_model("model.json")
# load model
bst = xgb.Booster(model_file="model.json")

# alternatively, you can pickle the booster
import pickle
with open('model.pkl', 'wb') as fout:
    pickle.dump(bst, fout)
with open('model.pkl', 'rb') as fin:
    bst = pickle.load(fin)

XGBoost在Booster对象中有一个名为dump_model的函数，它允许以text、json或dot（graphviz）等可读格式导出模型。它的主要用于模型解释或可视化，不应该重新加载回XGBoost。

python 复制代码

# dump model
bst.dump_model("dump.raw.txt")
# dump model with feature map
bst.dump_model("dump.nice.txt", os.path.join(DEMO_DIR, "data/featmap.txt"))

Step 5: Predict

python 复制代码

# run prediction
y_pred = bst.predict(dtest)
y_true = dtest.get_label()

# If early stopping is enabled during training, you can get predictions from the best iteration with bst.best_iteration:
y_pred = bst.predict(dtest, iteration_range=(0, bst.best_iteration + 1))

Step 6: Evaluating

python 复制代码

from sklearn.metric import mean_squared_error
rmse_test = mean_squared_error(y_true, y_pred) ** 0.5
print(f'The RMSE of prediction is: {rmse_test}')

参数

xgboost将参数分为了两大部分，一部分可以通过params进行设置，另一部分则需要在方法xgb.train或者xgb.cv中进行设置。遗憾的是，xgboost并没有明确对参数分割的条件和理由，但一般来说，除了迭代次数和提前停止这两个关键元素，其他参数基本都被设置在params当中。如果在实际运行过程中，出现了警告或报错，则根据实际情况进行调整。

一般参数

booster：指定算法类型。default= gbtree 可以是gbtree、gblinear或dart。gbtree和dart使用基于树的模型，而gblinear使用线性函数。
device：学习设备。default = cpu
nthread：如果未设置，默认为最大可用线程数。
seed：随机种子。
verbosity：打印消息的详细性。有效值为0（静音）、1（警告）、2（信息）和3（调试），default=1。可以使用 xgboost.config_context() 在全局范围内设置。
num_parallel_tree 每次迭代期间构建的并行树的数量。此选项用于支持增强的随机森林。default=1
multi_strategy 用于训练多目标模型的策略，包括多目标回归和多类分类。default= one_output_per_tree
- one_output_per_tree：每个目标一个模型。
- multi_output_tree：使用多目标树。

样本处理参数

scale_pos_weight 控制正负样本的权重平衡，典型值：sum(negative instances)/sum(positive instances) 。default=1

特征处理参数

max_cat_to_onehot 决定XGBoost是否使用one-hot编码的阈值。当类别数量小于阈值时，则选择one-hot编码，否则类别将被划分为子节点。
max_cat_threshold 每一次分裂的最大类别数
max_bin 最大分箱数。仅当tree_method设置为hist或approx时使用。default=256
Monotonic Constraints 单调约束
Feature Interaction Constraints 特征交互约束

决策树生成

tree_method XGBoost中使用的树构造算法。default=auto
- auto：与hist树方法相同。
- exact：精确的贪婪算法。列举所有拆分候选。
- approx：使用分位数草图和梯度直方图的近似贪婪算法。
- hist：直方图算法。
- 对于refresh等其他更新程序，请直接设置参数updater。
max_depth 一棵树的最大深度。default=6
max_leaves 要添加的最大节点数。default=0
min_child_weight 每个节点所需的最小实例数量。default=1
grow_policy 控制将新节点添加到树中的方式，目前仅在tree_method设置为hist或approx时支持。。default=depthwise
- depthwise：在最靠近根的节点上拆分。
- lossguide：在损失变化最大的节点上拆分。

迭代过程

eta 学习率，范围 [0,1]。default=0.3，别名 learning_rate
lambda L2正则化系数。default=1，别名 reg_lambda
alpha L1正则化系数。default=0，别名：reg_alpha
gamma 依照叶子总量对目标函数施加惩罚的系数。default=0，别名：min_split_loss

目标函数
O b j k = ∑ i l ( y i , y i ^ ) + γ T + 1 2 λ ∑ j = 1 T w j 2 + α ∑ j = 1 T w j Obj_k = \sum_{i}l(y_i,\hat{y_i}) + \gamma T + \frac{1}{2}\lambda\sum_{j=1}^Tw_j^2 + \alpha\sum_{j=1}^Tw_j Objk=i∑l(yi,yi^)+γT+21λj=1∑Twj2+αj=1∑Twj

其中 T T T表示当前第 k k k棵树上的叶子总量， w j w_j wj则代表当前树上第 j j j片叶子的叶子权重（leaf weights），即当前叶子 j j j的预测值。正则项有两个：使用平方的 ℓ 2 \ell_2 ℓ2正则项与使用绝对值的 ℓ 1 \ell_1 ℓ1正则项。

subsample 训练集的采样比率。子采样将在每次提升迭代中发生一次。default=1
sampling_method 训练集的子采样方法。default=uniform
- uniform：每个训练实例被选中的概率相等。通常设置subsample>= 0.5以获得良好的结果。
- gradient_based：每个训练实例的选择概率与梯度的正则化绝对值 成正比。更具体地说，subsample可以设置为低至0.1，而不会损失模型准确性。请注意，仅当tree_method设置为hist且设备为cuda才支持此采样方法；其他树方法仅支持uniform采样。
colsample_bytree, colsample_bylevel, colsample_bynode 这是用于特征子采样的参数系列。default=1
- colsample_bytree是构建每棵树时列的子采样比率。每构建一棵树，子采样都会发生一次。
- colsample_bylevel是每个级别的列的子采样比率。每在树上达到一个新的深度水平，就会进行子采样。是从当前树的列集进行子采样的。
- colsample_bynode是每个节点（拆分）的列子采样比率。每次评估新的拆分时，子采样都会发生一次。是从当前级别的列集进行子采样的。
- colsample_by*参数累积工作。例如，具有64个特征的组合{'colsample_bytree':0.5,'colsample_bylevel':0.5,'colsample_bynode':0.5}将在每次拆分时留下8个特征可供选择。
- 构建数据集时，可以为DMatrix设置feature_weights，以定义使用列采样时选择每个特征的概率。sklearn界面中的fit方法有一个类似的参数。
updater 提供了构建和修改树的模块化方式。这是一个高级参数，通常会自动设置。
- grow_colmaker：非分布式柱式树结构。
- grow_histmaker：基于直方图计数的全局提案，基于行的数据拆分的分布式树结构。
- grow_quantile_histmaker：使用量化直方图构建树。
- grow_gpu_hist：当tree_method与device=cuda一起设置为hist启用。
- grow_gpu_approx：当tree_method与device=cuda一起设置为approx启用。
- sync：同步所有分布式节点中的树。
- refresh：根据当前数据刷新树的叶节点权重和/或叶节点值。请注意，不会对数据行进行随机子采样。
- prune：修剪损失小于 min_split_loss（或gamma）和深度大于max_depth的节点。
refresh_leaf 这是refresh更新程序的一个参数。当设置为1时，叶节点值和权重都会更新。当设置为0时，只更新叶节点权重。default=1
process_type 指定提升过程。default=default
- default：创造新树的正常提升过程。
- update：从现有模型开始，仅更新现有的树。在每次提升迭代中，从初始模型中获取一棵树，为该树运行指定的更新程序，并将修改后的树添加到新模型中。新模型将具有相同或更少的树，这取决于执行的增强迭代次数。目前，仅 updater 设置为 refresh或prune时有意义。使用process_type=update时，不能使用创建新树的更新程序。
max_delta_step 一次迭代中所允许的最大迭代值。通常不需要这个参数，但当类极度不平衡时，它可能有助于逻辑回归。将其设置为1-10的值可能有助于控制更新。default=0

树方法：对于训练 boosted tree 模型，有2个参数用于选择算法，即updater和tree_method。XGBoost有3种内置树方法，即exact、approx和hist。除了这些树方法外，还有一些独立的更新程序，包括refresh、prune和sync。参数updater比tree_method更原始，因为后者只是前者的预配置，差异主要是由于历史原因。

模型训练

objective 选择需要优化的损失函数。default=reg:squarederror
- 回归问题： reg:squarederror、 reg:squaredlogerror、 reg:pseudohubererror、reg:absoluteerror、reg:quantileerror、pinballloss、count:poisson、reg:gamma、reg:tweedie
- 分类问题： reg:logistic、 binary:logistic、 binary:logitraw、binary:hinge、multi:softprob、multi:softmax
- 生存分析：survival:cox、 survival:aft
- 排序问题：rank:ndcg、 rank:map、rank:pairwise
base_score 初始化预测结果 H 0 H_0 H0的设置
eval_metric 评估指标。将根据 objective分配默认值：回归的rmse，分类的logloss，rank:map的平均精度等。支持添加多个评估指标。
- 回归问题： rmse、rmsle、mae、 mape、mphe
- 分类问题：logloss、 error、error@t 可以通过 t 来指定与0.5不同的二分类阈值、 merror、 mlogloss、 auc、aucpr、 map
disable_default_eval_metric：是否禁用默认评估函数。default= False

module	comment
xgboost.train	指定参数训练
xgboost.cv	交叉验证训练

主要参数：

params - Booster 参数字典
dtrain 用于训练的数据集
num_boost_round 提升迭代次数，即生成的基学习器的数量
evals 验证/测试数据
obj 自定义目标函数
feval 自定义评估函数（已废弃）
maximize 是否最大化 feval
early_stopping_rounds 提前停止，需要至少一个evals。如果evals、eval_metric不止一个，则选用最后一个判断提前停止
evals_result 记录验证集的评估结果
verbose_eval
xgb_model 初始化模型，允许继续训练
callbacks 回调函数列表
custom_metric 自定义评估函数
nfold CV值
stratified 是否分层抽样
folds sklearn - a KFold or StratifiedKFold instance or list of fold indices
as_pandas 是否转化为pandas
show_stdv 是否打印标准差

回调参数

方法	Create a callback
`xgboost.callback.TrainingCallback`	Interface for training callback.
`xgboost.callback.EvaluationMonitor(rank=0, period=1, show_stdv=False)`	输出评估结果的频率
`xgboost.callback.EarlyStopping(rounds)`	回调提前停止策略，控制过拟合风险，当验证集上的精度若干轮不下降，提前停止训练。
`xgboost.callback.LearningRateScheduler(learning_rates)`	调度学习率

python 复制代码

D_train = xgb.DMatrix(X_train, y_train)
D_valid = xgb.DMatrix(X_valid, y_valid)

# Define a custom evaluation metric used for early stopping.
def eval_error_metric(predt, dtrain: xgb.DMatrix):
    label = dtrain.get_label()
    r = np.zeros(predt.shape)
    gt = predt > 0.5
    r[gt] = 1 - label[gt]
    le = predt <= 0.5
    r[le] = label[le]
    return 'CustomErr', np.sum(r)

# Specify which dataset and which metric should be used for early stopping.
early_stop = xgb.callback.EarlyStopping(rounds=early_stopping_rounds,
                                        metric_name='CustomErr',
                                        data_name='Train')

booster = xgb.train(
    params = {'objective': 'binary:logistic',
              'eval_metric': ['error', 'rmse'],
              'tree_method': 'hist'}, 
    dtrain = D_train,
    evals=[(D_train, 'Train'), (D_valid, 'Valid')],
    feval=eval_error_metric,
    num_boost_round=1000,
    callbacks=[early_stop],
    verbose_eval=False)

自定义损失函数

xgboost 在 xgb.train中通过参数obj和custom_metric来自定损失函数和评估函数。

自定义损失函数接受predt和dtrain作为输入，返回损失函数的一阶(grad)和二阶(hess)导数。

python 复制代码

import xgboost as xgb
from typing import Tuple

def gradient(predt: np.ndarray, dtrain: xgb.DMatrix) -> np.ndarray:
    '''Compute the gradient squared log error.'''
    y = dtrain.get_label()
    return (np.log1p(predt) - np.log1p(y)) / (predt + 1)

def hessian(predt: np.ndarray, dtrain: xgb.DMatrix) -> np.ndarray:
    '''Compute the hessian for squared log error.'''
    y = dtrain.get_label()
    return ((-np.log1p(predt) + np.log1p(y) + 1) /
            np.power(predt + 1, 2))

def squared_log(predt: np.ndarray,
                dtrain: xgb.DMatrix) -> Tuple[np.ndarray, np.ndarray]:
    '''Squared Log Error objective. A simplified version for RMSLE used as
    objective function.
    
    :math:`\frac{1}{2}[log(pred + 1) - log(label + 1)]^2`
    '''
    predt[predt < -1] = -1 + 1e-6
    grad = gradient(predt, dtrain)
    hess = hessian(predt, dtrain)
    return grad, hess

自定义损失函数后，模型的输出不在是 [0,1] 概率输出，而是 sigmoid 函数之前的输入值。因此，需要写出对应的评估函数。

python 复制代码

def rmsle(predt: np.ndarray, dtrain: xgb.DMatrix) -> Tuple[str, float]:
    ''' Root mean squared log error metric.'''
    y = dtrain.get_label()
    predt[predt < -1] = -1 + 1e-6
    elements = np.power(np.log1p(y) - np.log1p(predt), 2)
    return 'PyRMSLE', float(np.sqrt(np.sum(elements) / len(y)))

评估函数也接受predt和dtrain作为输入，返回本身的名称和浮点值作为结果。

python 复制代码

xgb.train({'tree_method': 'hist', 'seed': 1994,
           'disable_default_eval_metric': 1},
          dtrain=dtrain,
          num_boost_round=10,
          obj=squared_log,
          custom_metric=rmsle,
          evals=[(dtrain, 'dtrain'), (dtest, 'dtest')],
          evals_result=results)

请注意，参数disable_default_eval_metric用于抑制XGBoost中的默认度量。

当自定义损失函数后，模型 predict 将会输出原始值，需要手动进行sigmoid函数变换。可以通过predict函数中的output_margin参数来控制

Scikit-Learn API

XGBoost的原生代码与我们已经习惯了的sklearn代码有很大的不同。对于熟悉sklearn的我们来说，许多人也会倾向于使用xgboost自带的sklearn接口来实现算法。通过这个接口，我们可以使用跟sklearn代码一样的方式来实现xgboost，即可以通过fit和predict等接口来执行训练预测过程，也可以调用属性比如coef_等。

在XGBoost的sklearn API中，我们可以看到下面五个类：

module	comment
XGBRegressor	实现xgboost回归
XGBClassifier	实现xgboost分类
XGBRanker	实现xgboost排序
XGBRFClassifier	基于xgboost库实现随机森林分类
XGBRFRegressor	基于xgboost库实现随机森林回归

其中XGBRF的两个类是以XGBoost方式建树、但以bagging方式构建森林的类，通常只有在我们使用普通随机森林效果不佳、但又不希望使用Boosting的时候使用。这种使用XGBoost方式建树的森林在sklearn中已经开始了实验，不过还没有正式上线。

另外两个类就很容易理解了，一个是XGBoost的回归，一个是XGBoost的分类。这两个类的参数高度相似，我们可以以XGBoost分类为例查看：

python 复制代码

XGBClassifier(
    n_estimators : int = None,
    max_depth : int = None,
    max_leaves : int = None,
    max_bin : int = None,
    grow_policy : {0, 1} = None,
    learning_rate : float = None,
    objective: Union[str, Callable, NoneType] = "binary:logistic",
    booster : str = None, # gbtree, gblinear or dart.
    tree_method : str = None,
    n_jobs : int = None,
    gamma : float = None,
    min_child_weight : float = None,
    max_delta_step : float = None,
    subsample : float = None,
    sampling_method : {"uniform", "gradient_based"} = None,
    colsample_bytree : float = None,
    colsample_bylevel : float = None,
    colsample_bynode : float = None,
    reg_alpha : float = None,
    reg_lambda : float = None,
    scale_pos_weight : float = None,
    base_score : NoneType = None,
    missing : float = np.nan,
    num_parallel_tree : int = None,
    monotone_constraints : Union[Dict[str, int], str]] = None,
    interaction_constraints : Union[str, List[Tuple[str]]] = None, 
    importance_type : str = None,
    device : {"cpu", "cuda", "gpu"} = None,
    validate_parameters : bool = None,
    enable_categorical : bool = False,
    feature_types : FeatureTypes = None,
    max_cat_to_onehot : int = None,
    max_cat_threshold : int = None,
    multi_strategy : {"one_output_per_tree", "multi_output_tree"} = None,
    eval_metric : Union[str, List[str], Callable] = None,
    early_stopping_rounds : int = None,
    callbacks : List[TrainingCallback] = None,
    random_state : Union[numpy.random.RandomState, int] = None,
    verbosity : int = None,
    **kwargs : dict = None
)

具体的模型训练过程和sklearn中其他模型一样，通过fit进行训练，并利用predict进行结果输出：

python 复制代码

from xgboost import XGBClassifier
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split

# read data
X, y = load_iris(return_X_y=True)
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=.2)
# create model instance
clf = XGBClassifier(n_estimators=2, max_depth=2, learning_rate=1, objective='binary:logistic')
# fit model
clf.fit(X_train, y_train)
# make predictions
preds = clf.predict(X_test)
# Save model into JSON format.
clf.save_model("clf.json")

可视化

module	comment
plot_importance(booster)	绘制模型的特征重要性。
plot_tree(booster)	绘制指定的树
to_graphviz(booster)	创建指定树的二叉图文件

继续训练

XGBoost提供两种增量学习的方式：

一种是在当前迭代树的基础上增加新树，原树不变；
一种是当前迭代树结构不变，重新计算叶节点权重和/或叶节点值。

在初始化模型 xgb_model 上继续训练

python 复制代码

# Train 128 iterations, with the first one runs for 32 iterations and
# the second one runs for 96 iterations
clf1 = xgboost.XGBClassifier(n_estimators=32)
clf1.fit(X, y, eval_set=[(X, y)], eval_metric="logloss")
assert clf1.get_booster().num_boosted_rounds() == 32

clf2 = xgboost.XGBClassifier(n_estimators=128 - 32)
clf2.fit(X, y, eval_set=[(X, y)], eval_metric="logloss", xgb_model=clf1)

print("Total boosted rounds:", clf.get_booster().num_boosted_rounds())

使用process_type参数更新叶节点

python 复制代码

# using `process_type` with `prune` and `refresh`
n_rounds=32

# Train a model first
Xy = xgb.DMatrix(X_train, y_train)
evals_result = {}
booster = xgb.train(
    {"tree_method": "hist", "max_depth": 6, "device": "cuda"},
    Xy,
    num_boost_round=n_rounds,
    evals=[(Xy, "Train")],
    evals_result=evals_result,
)

# Refresh the leaf value and tree statistic
Xy_refresh = xgb.DMatrix(X_refresh, y_refresh)
# The model will adapt to new data by changing leaf value (no change in
# split condition) with refresh_leaf set to True.
refresh_result = {}
refreshed = xgb.train(
    {"process_type": "update", "updater": "refresh", "refresh_leaf": True},
    Xy_refresh,
    num_boost_round=n_rounds,
    xgb_model=booster,
    evals=[(Xy, "Original"), (Xy_refresh, "Train")],
    evals_result=refresh_result,
)

# Refresh the model without changing the leaf value, but tree statistic including
# cover and weight are refreshed.
refresh_result = {}
refreshed = xgb.train(
    {"process_type": "update", "updater": "refresh", "refresh_leaf": False},
    Xy_refresh,
    num_boost_round=n_rounds,
    xgb_model=booster,
    evals=[(Xy, "Original"), (Xy_refresh, "Train")],
    evals_result=refresh_result,
)

# Prune the trees with smaller max_depth
Xy_update = xgb.DMatrix(X_update, y_update)
prune_result = {}
pruned = xgb.train(
    {"process_type": "update", "updater": "prune", "max_depth": 2},
    Xy_update,
    num_boost_round=n_rounds,
    xgb_model=booster,
    evals=[(Xy, "Original"), (Xy_update, "Train")],
    evals_result=prune_result,
)

分布式学习

XGBoost with PySpark

从1.7.0版本开始，xgboost已经封装了pyspark API，因此不需要纠结spark版本对应的jar包 xgboost4j 和 xgboost4j-spark 的下载问题了，也不需要下载调度包 sparkxgb.zip。

算法	说明
xgboost.spark.SparkXGBClassifier	PySpark分类算法
xgboost.spark.SparkXGBRegressor	PySpark回归算法
xgboost.spark.SparkXGBRanker	PySpark排名算法

以 SparkXGBClassifier 为例，介绍下XGBoost在spark中的用法

python 复制代码

xgboost.spark.SparkXGBClassifier(
    features_col='features', 
    label_col='label', 
    prediction_col='prediction', 
    probability_col='probability', 
    raw_prediction_col='rawPrediction', 
    pred_contrib_col=None, 
    validation_indicator_col=None, 
    weight_col=None, 
    base_margin_col=None, 
    num_workers=1, 
    use_gpu=None, 
    device=None, 
    force_repartition=False, 
    repartition_random_shuffle=False, 
    enable_sparse_data_optim=False, 
    **kwargs)

python 复制代码

from xgboost.spark import SparkXGBClassifier
from pyspark.ml.linalg import Vectors

spark = SparkSession.builder.master("local[*]").getOrCreate()

# create dataset
df_train = spark.createDataFrame([
    (Vectors.dense(1.0, 2.0, 3.0), 0, False, 1.0),
    (Vectors.sparse(3, {1: 1.0, 2: 5.5}), 1, False, 2.0),
    (Vectors.dense(4.0, 5.0, 6.0), 0, True, 1.0),
    (Vectors.sparse(3, {1: 6.0, 2: 7.5}), 1, True, 2.0),
], ["features", "label", "isVal", "weight"])
df_test = spark.createDataFrame([
    (Vectors.dense(1.0, 2.0, 3.0), ),
], ["features"])

# train xgboost classifier model
clf = SparkXGBClassifier(max_depth=5, missing=0.0,
    validation_indicator_col='isVal', weight_col='weight',
    early_stopping_rounds=1, eval_metric='logloss')
model = xgb_classifier.fit(df_train)
predict_df = model.transform(df_test)

classifier_evaluator = MulticlassClassificationEvaluator(metricName="f1")
print(f"classifier f1={classifier_evaluator.evaluate(predict_df)}")