python:reportlab 生成PDF文件,生成基因图谱

reportLab是 python的一个第三方库,它能够用来生成PDF文件。这个库提供了一系列的工具,允许用户从简单的文档到复杂的多列布局进行PDF的创建和编辑。

使用 reportLab,你可以执行以下功能:

创建文本块、图片、图表等元素。

利用绘图功能在PDF上绘制基本图形,如矩形、圆形、线条等。

利用表格功能在PDF上创建表格并填充数据。

使用样式和模板快速格式化文档。

组合这些元素,创建具有复杂布局的文档。

reportLab 使用非常灵活,可以根据用户的需要生成各种格式的PDF文档,无论是简单的报告还是复杂的报表,或者是带有个性化风格的文档。它也被广泛应用于生成商业报告、合同、财务报表、发票等多种类型的应用场景中。

pip install reportlab

Downloading reportlab-4.2.2-py3-none-any.whl (1.9 MB)

编写 test_reportlab.py 如下

python 复制代码
# -*- coding: utf-8 -*-
""" 生成简单的PDF文件 """
from reportlab.lib.styles import getSampleStyleSheet
from reportlab.platypus import Paragraph,SimpleDocTemplate
from reportlab.lib import  colors

from reportlab.pdfbase import pdfmetrics
from reportlab.pdfbase.ttfonts import TTFont
# 注册中文字体
pdfmetrics.registerFont(TTFont('song',r'C:\Windows\Fonts\STSONG.ttf'))

Style=getSampleStyleSheet()
bt = Style['Normal']     #字体的样式
bt.fontName = 'song'     #使用的字体
bt.fontSize = 14         #字号
#该属性支持自动换行,'CJK'是中文模式换行,用于纯英文时,可改为'Normal'
bt.wordWrap = 'CJK'
bt.firstLineIndent = 32  #该属性支持第一行开头空格
bt.leading = 20          #该属性是设置行距
ct = Style['Normal']
ct.fontName = 'song'
ct.fontSize = 12
ct.alignment = 1         #居中
ct.textColor = colors.red
t = Paragraph('hello,中文显示', bt)
pdf = SimpleDocTemplate('test.pdf')
pdf.multiBuild([t])

运行 python test_reportlab.py

生成 test.pdf


由于原始代码中缺少 draw_gene_chart函数的实现,以下是一个简化的示例,展示如何使用reportlab库生成一个基因图谱的PDF文档。

python 复制代码
from reportlab.pdfgen import canvas
from reportlab.lib.pagesizes import letter
 
def draw_gene_chart(c, x, y, width, height, gene_name):
    """
    在指定位置绘制基因名称
    :param c: canvas对象
    :param x: x坐标
    :param y: y坐标
    :param width: 宽度
    :param height: 高度
    :param gene_name: 基因名称
    """
    c.drawString(x, y, gene_name)
 
def create_gene_chart_pdf(gene_name, output_file):
    """
    创建基因图谱PDF
    :param gene_name: 基因名称
    :param output_file: 输出文件路径
    """
    c = canvas.Canvas(output_file, pagesize=letter)
    width, height = 100, 20  # 定义基因名称的大小
    x, y = 50, 750  # 定义绘制基因名称的位置
    draw_gene_chart(c, x, y, width, height, gene_name)
    c.save()
 
# 使用函数创建PDF
create_gene_chart_pdf('ExampleGene', 'gene_chart.pdf')

这段代码定义了一个 draw_gene_chart函数,用于在PDF文档中的指定位置绘制基因名称。create_gene_chart_pdf函数则负责创建PDF文件,并调用draw_gene_chart函数来绘制基因图谱。

请注意,这个示例没有实现复杂的绘图逻辑,而是展示了如何使用reportlab库的基本功能来绘制文本。在实际的基因图谱中,可能需要使用更复杂的绘图命令来表示基因的结构和功能信息。

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