发现PVN3D中使用到了pointnet2和 densfusion等网络,为了看懂pvn3d,因此得看看pointnet2,然而带cpp,cu文件的程序一时办事编译不成功,因此找到了一个 Pointnet_Pointnet2_pytorch-master,里面有pointnet和pointnet2网络,在这个程序中学习pointnet2.
首先看Pointnet2_utils.py文件
1.pc_normalize函数
这一个是点归一化,就是找到点集合得中心,然后每个点都减去这个中心,然后计算x*x+y*y+z*z再开根号,得到距离。使用max计算最大距离,然后让每一个重心化之后的点除上这个距离,就得到了归一化得坐标。
def pc_normalize(pc):
l = pc.shape[0] #点的个数
centroid = np.mean(pc, axis=0) #点的中心
pc = pc - centroid #重心化
m = np.max(np.sqrt(np.sum(pc**2, axis=1))) #计算得到点里中心点的最大距离
pc = pc / m #除上最大距离
return pc
2.square_distance
M个点和N个点之间的距离构成了N*M矩阵, 每一个元素(i,j)中的值存储的都是,点集合N中的第i个点和 点集合M中的第j个点之间的距离。
#计算距离矩阵 比如src是 B组N个点 dst是B组M个点, 则最后得到的距离矩阵是 B组N行M列
def square_distance(src, dst):
"""
Calculate Euclid distance between each two points.
src^T * dst = xn * xm + yn * ym + zn * zm;
sum(src^2, dim=-1) = xn*xn + yn*yn + zn*zn;
sum(dst^2, dim=-1) = xm*xm + ym*ym + zm*zm;
dist = (xn - xm)^2 + (yn - ym)^2 + (zn - zm)^2
= sum(src**2,dim=-1)+sum(dst**2,dim=-1)-2*src^T*dst
Input:
src: source points, [B, N, C]
dst: target points, [B, M, C]
Output:
dist: per-point square distance, [B, N, M]
"""
B, N, _ = src.shape #B组M个点
_, M, _ = dst.shape #B组B个点
dist = -2 * torch.matmul(src, dst.permute(0, 2, 1)) #B组 N行M列矩阵,每一个元素都是-2*i*j
dist += torch.sum(src ** 2, -1).view(B, N, 1) #平方项,使用了广播特性
dist += torch.sum(dst ** 2, -1).view(B, 1, M) #平方项,使用了广播特性
return dist
3.index_points
根据点索引提取点坐标或者点属性特征矢量
#根据idx 索引得到点位置或者属性
def index_points(points, idx):
"""
Input:
points: input points data, [B, N, C]
idx: sample index data, [B, S]
Return:
new_points:, indexed points data, [B, S, C]
"""
device = points.device #点所在的设备
B = points.shape[0] #B组
view_shape = list(idx.shape) #
view_shape[1:] = [1] * (len(view_shape) - 1)
repeat_shape = list(idx.shape)
repeat_shape[0] = 1
batch_indices = torch.arange(B, dtype=torch.long).to(device).view(view_shape).repeat(repeat_shape)
new_points = points[batch_indices, idx, :]
return new_points
4.最远点采样
算法原理比较简单,首先随机生成B*1的farthest,作为centroids的第一次选择的点索引,然后
使用xyz[batch_indices, farthest, :].view(B, 1, 3) 把这些索引到的点给提取出来,然后让每一组中的点都减去对应组的索引点,再计算距离,再第0次迭代中,由于计算出来的点点距离都小于1e10,因此distance都被更新了。
这时候选择出来最大距离点,就是第二个最远点。选择该最远点的索引作为第1次迭代(注意从第0次迭代开始),然后还是与每一个点进行比较,计算距离,如果距离小于distance中的距离,则让该距离小的值填充distance中对应位置,最后,在选择该轮中distance中的最大值所对应的索引作为 farthest。
相当于每一组一个distanceK,每一次都用距离最小值更新distanceK, 等同于选择与 最远点集中所有点 距离最小的点中的 距离最大点,有点绕口,详细来说,分为三步:
1)让剩余点集中的一个点,与最远点集中的所有点计算距离,选择最小距离
2)遍历1),得到剩余点集中每一个点 到 最远点集中的 最小距离
3)在所有最小距离中,选择最大距离所对应的点
def farthest_point_sample(xyz, npoint):
"""
Input:
xyz: pointcloud data, [B, N, 3]
npoint: number of samples
Return:
centroids: sampled pointcloud index, [B, npoint]
"""
device = xyz.device #设备
B, N, C = xyz.shape #batch n个点 c
centroids = torch.zeros(B, npoint, dtype=torch.long).to(device)
distance = torch.ones(B, N).to(device) * 1e10 #B*N矩阵,
farthest = torch.randint(0, N, (B,), dtype=torch.long).to(device) # 随机生成B个 0-N中的数值
batch_indices = torch.arange(B, dtype=torch.long).to(device) #B个索引值
for i in range(npoint):
centroids[:, i] = farthest # 第0次是 随机的索引,
centroid = xyz[batch_indices, farthest, :].view(B, 1, 3) #batch_indices = :, farthest, centroid得到中心点
dist = torch.sum((xyz - centroid) ** 2, -1) # 减去 farthest 所对应的点,得到距离值
mask = dist < distance #生成掩膜
distance[mask] = dist[mask] #把dist中比distance中对应位置更小的距离,更新到distance中
farthest = torch.max(distance, -1)[1] #最大距离值的索引
return centroids
5.query_ball_point
功能:让group_idx 为N的位置填充上 每一组中每一行第一个元素值,相当于是小于nsample个点的时候,就填充第一个点的索引
理解:最远采样点为中心,得到小于中心+radius 区域内的点的索引,如果不够,则使用第一个查询的点的索引进行填充。最终每一个组中,每一个点,都采样到了相同个数(nsample个)的点,
def query_ball_point(radius, nsample, xyz, new_xyz):
"""
Input:
radius: local region radius
nsample: max sample number in local region
xyz: all points, [B, N, 3]
new_xyz: query points, [B, S, 3]
Return:
group_idx: grouped points index, [B, S, nsample]
"""
device = xyz.device
B, N, C = xyz.shape
_, S, _ = new_xyz.shape
group_idx = torch.arange(N, dtype=torch.long).to(device).view(1, 1, N).repeat([B, S, 1]) #group_idx =[B,S,N]
sqrdists = square_distance(new_xyz, xyz) #得到new_xyz和xyz之间的距离矩阵
group_idx[sqrdists > radius ** 2] = N #距离矩阵中的值大于查询半径的时候,,索引值设置为N,
group_idx = group_idx.sort(dim=-1)[0][:, :, :nsample] #按照行进行排序(相当于对一行中的所有列进行排序),只选取前nsample个
group_first = group_idx[:, :, 0].view(B, S, 1).repeat([1, 1, nsample]) #让每一组中每一行第一个元素值,填充group_first
mask = group_idx == N #制作一个掩膜
group_idx[mask] = group_first[mask] #让group_idx 为N的位置填充上 每一组中每一行第一个元素值,相当于是小于nsample个点的时候,就填充第一个点的索引
return group_idx #返回索引
6.sample_and_group
这个函数的活,除了最远点采样和聚组 这两个函数,剩下的就是一个根据索引计算属性的函数了,然后把点位置和点属性进行特征连接,得到心得特征。
def sample_and_group(npoint, radius, nsample, xyz, points, returnfps=False):
"""
Input:
npoint:
radius:
nsample:
xyz: input points position data, [B, N, 3]
points: input points data, [B, N, D]
Return:
new_xyz: sampled points position data, [B, npoint, nsample, 3]
new_points: sampled points data, [B, npoint, nsample, 3+D]
"""
B, N, C = xyz.shape
S = npoint
fps_idx = farthest_point_sample(xyz, npoint) # [B, npoint, C]
new_xyz = index_points(xyz, fps_idx) #得到最远点采样的点集合
idx = query_ball_point(radius, nsample, xyz, new_xyz)
grouped_xyz = index_points(xyz, idx) # [B, npoint, nsample, C] #得到球查询的点的组
grouped_xyz_norm = grouped_xyz - new_xyz.view(B, S, 1, C) #使用最远采样点作为中心点,进行重心化
if points is not None:
grouped_points = index_points(points, idx) #对属性/特征进行采样
new_points = torch.cat([grouped_xyz_norm, grouped_points], dim=-1) # [B, npoint, nsample, C+D] 连接点位置(3) 和 点特征
else:
new_points = grouped_xyz_norm #只要点位置,没有点属性
if returnfps:
return new_xyz, new_points, grouped_xyz, fps_idx
else:
return new_xyz, new_points #返回了最远点采样中心点,和生成的特征
7.sample_and_group_all
传进来的点和属性全都用,不做采样了,然后如果有属性,就把位置和属性连接起来构成新的属性,如果没有属性,则只使用位置。
def sample_and_group_all(xyz, points):
"""
Input:
xyz: input points position data, [B, N, 3]
points: input points data, [B, N, D]
Return:
new_xyz: sampled points position data, [B, 1, 3]
new_points: sampled points data, [B, 1, N, 3+D]
"""
device = xyz.device
B, N, C = xyz.shape
new_xyz = torch.zeros(B, 1, C).to(device)
grouped_xyz = xyz.view(B, 1, N, C)
if points is not None:
new_points = torch.cat([grouped_xyz, points.view(B, 1, N, -1)], dim=-1)
else:
new_points = grouped_xyz
return new_xyz, new_points
8.PointNetSetAbstractionMsg
PointNetSetAbstractionMsg(512, [0.1, 0.2, 0.4], [16, 32, 128], in_channel,[[32, 32, 64], [64, 64, 128], [64, 96, 128]])
看这一行参数,表示,最远点采样采集512个点作为中心点,开始聚组,球半径分别为,0.1,0.2,0.3,在每一个半径中选择16个点,32个点和128个点。in_chanenl在第一次时候为3(位置),为6(带法向)。分别生成了:
B*512*16*3 通道为3,最远点采样了512个点,每个点组了16个点,每个点是3维。
B*512*32*3
B*512*128*3
三个张量。
第一个SA:
然后B*512*16*3 通道为3,[32, 32, 64]分别relu(bn(conv()))三件套,三角套第一次生成 B*32* 512*16,max后把组点个数给销毁,变成B*32* 512; 在第一次基础上第二次生成B*32* 512*16,,max后把组点个数给销毁,变成B*32* 512; 在第二次基础上第三次生成B*64* 512*16,,max后把组点个数给销毁,变成B*64* 512. 。
new_xyz, 为512个点
new_points 选中列表最后一个数值,[32, 32, 64], [64, 64, 128], [64, 96, 128]], 因此结果为:B*(64+ 128 + 128)* 512 ,为 B* 320* 512.
也就是第一次SA后得到new_xyz(512个点),new_points (B* 320* 512)
第二个SA:
self.sa2 = PointNetSetAbstractionMsg(128, [0.2, 0.4, 0.8], [32, 64, 128], 320,[[64, 64, 128], [128, 128, 256], [128, 128, 256]])
同理,是在512个点中采集128个点,这一次特征矢量是320维度+3位置=323,最后计算结果就是
B*(128+ 256+ 256)* 512 ,为 B* 640* 512.
第三个SA:
PointNetSetAbstraction(None, None, None, 640 + 3, [256, 512, 1024], True)
显然,三次三件套后就是 B* 1024* 128,128是第二次SA中的最远采样点个数,然后max一下变成了B* 1024矢量
# PointNetSetAbstractionMsg(512, [0.1, 0.2, 0.4], [16, 32, 128], in_channel,[[32, 32, 64], [64, 64, 128], [64, 96, 128]])
class PointNetSetAbstraction(nn.Module):
def __init__(self, npoint, radius, nsample, in_channel, mlp, group_all):
super(PointNetSetAbstraction, self).__init__()
self.npoint = npoint
self.radius = radius
self.nsample = nsample
self.mlp_convs = nn.ModuleList()
self.mlp_bns = nn.ModuleList()
last_channel = in_channel
for out_channel in mlp:
self.mlp_convs.append(nn.Conv2d(last_channel, out_channel, 1))
self.mlp_bns.append(nn.BatchNorm2d(out_channel))
last_channel = out_channel
self.group_all = group_all
def forward(self, xyz, points):
"""
Input:
xyz: input points position data, [B, C, N]
points: input points data, [B, D, N]
Return:
new_xyz: sampled points position data, [B, C, S]
new_points_concat: sample points feature data, [B, D', S]
"""
xyz = xyz.permute(0, 2, 1)
if points is not None:
points = points.permute(0, 2, 1)
if self.group_all:
new_xyz, new_points = sample_and_group_all(xyz, points)
else:
new_xyz, new_points = sample_and_group(self.npoint, self.radius, self.nsample, xyz, points)
# new_xyz: sampled points position data, [B, npoint, C]
# new_points: sampled points data, [B, npoint, nsample, C+D]
new_points = new_points.permute(0, 3, 2, 1) # [B, C+D, nsample,npoint]
for i, conv in enumerate(self.mlp_convs):
bn = self.mlp_bns[i]
new_points = F.relu(bn(conv(new_points)))
new_points = torch.max(new_points, 2)[0]
new_xyz = new_xyz.permute(0, 2, 1)
return new_xyz, new_points
9.get_model
最后一次PointNetSetAbstraction,生成了一个表示该物体的一个特征向量。该向量被送到全连接层,最后一层就是分类个数(40或10)了。
B* 1024矢量经过,1024--->512---》256---》num_class(10或者40),就得到了类别输出,这时候和标签真值使用softmax作为loss函数,计算得到误差。
class get_model(nn.Module):
def __init__(self,num_class,normal_channel=True):
super(get_model, self).__init__()
in_channel = 3 if normal_channel else 0
self.normal_channel = normal_channel
self.sa1 = PointNetSetAbstractionMsg(512, [0.1, 0.2, 0.4], [16, 32, 128], in_channel,[[32, 32, 64], [64, 64, 128], [64, 96, 128]])
self.sa2 = PointNetSetAbstractionMsg(128, [0.2, 0.4, 0.8], [32, 64, 128], 320,[[64, 64, 128], [128, 128, 256], [128, 128, 256]])
self.sa3 = PointNetSetAbstraction(None, None, None, 640 + 3, [256, 512, 1024], True)
self.fc1 = nn.Linear(1024, 512)
self.bn1 = nn.BatchNorm1d(512)
self.drop1 = nn.Dropout(0.4)
self.fc2 = nn.Linear(512, 256)
self.bn2 = nn.BatchNorm1d(256)
self.drop2 = nn.Dropout(0.5)
self.fc3 = nn.Linear(256, num_class)
def forward(self, xyz):
B, _, _ = xyz.shape
if self.normal_channel:
norm = xyz[:, 3:, :]
xyz = xyz[:, :3, :]
else:
norm = None
l1_xyz, l1_points = self.sa1(xyz, norm)
l2_xyz, l2_points = self.sa2(l1_xyz, l1_points)
l3_xyz, l3_points = self.sa3(l2_xyz, l2_points)
x = l3_points.view(B, 1024)
x = self.drop1(F.relu(self.bn1(self.fc1(x))))
x = self.drop2(F.relu(self.bn2(self.fc2(x))))
x = self.fc3(x)
x = F.log_softmax(x, -1)
return x,l3_points