【Pytorch】Conda环境pack打包迁移报错处理

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Anaconda虚拟环境打包

实验在本机上验证成功,需要网高级设备上迁移,单张4090D,跑一个128k多模态大模型在一个数据集上推理加评测都花了两个半小时,还是太费时间了,重任亟需交给8A100机。

从源电脑中迁移anaconda的环境到目标电脑,首先两个电脑都安装了anaconda才行,在此基础上。

一、源电脑的环境打包

使用Anaconda Prompt操作

1.安装conda-pack工具

conda install conda-pack

2.确定环境

conda env list

找到你想要打包环境名。比如我的环境名是VLM

3.打包环境

conda pack -n VLM -o VLM.tar.gz

4.将打包环境拷贝到U盘

Windows环境打包在当前目录,如XX为用户名,路径为

C:/Users/XX/VLM.tar.gz

Linux同理

二、环境迁移到目标电脑上

①方法一

1.用Anaconda Prompt创建新环境,比如新环境是py310:

conda create -n py310 python=3.10

2.将U盘中的打包环境,拷贝在目标电脑的用户名目录:

C:/Users/XX/Py36.tar.gz

3.用Anaconda Prompt将打包环境,解压到新环境路径下:

tar -zxvf Py36.tar.gz -C E:\anaconda3\envs\py36\

4.激活新环境

conda activate py310

注意:如果失败的话,试一下方法二:

②方法二

1.找到目标电脑的环境文件夹

环境的路径为anaconda的所在目录下的envs文件夹,如我的为:E:\anaconda3\envs,以下步骤都在这个路径下进行操作。

2.将U盘中的打包环境,拷贝在环境文件夹envs内。

3.在环境路径下使用cmd命令行,新建文件夹,命名为py36:

mkdir py36

或者手动新建文件夹

4.使用cmd命令行,将打包环境解压到新环境中

tar -zxvf Py36.tar.gz -C ./py36

三、异常处理

pip install -e. 导致无法pack→忽略

报错如下

Collecting packages...
CondaPackError: Cannot pack an environment with editable packages
installed (e.g. from `python setup.py develop` or
 `pip install -e`). Editable packages found:

- /home/xxx

改用下面方式

conda pack -n VLM -o VLM.tar.gz --ignore-editable-packages

解压缩使用

mkdir ~/ananconda/envs/pcdet-tmp
tar -xf pcdet.tar.gz -C ~/ananconda/envs/pcdet-tmp
cd ~/ananconda/envs/pcdet-tmp
source ./bin/activate

管理的文件已经被删除或者被覆盖→压缩成tar

CondaPackError:  
	Files managed by conda were found to have been deleted/overwritten in the following packages: 
		 - charset-normalizer 2.0.4:
		 - xxxx
This is usually due to `pip` uninstalling or clobbering conda managed files,
resulting in an inconsistent environment. Please check your environment for
conda/pip conflicts using `conda list`, and fix the environment by ensuring
only one version of each package is installed (conda preferred).

解决方案尝试过利用WSL优势直接在Windows下对anaconda中环境env进行打包,然而报出巨量的依赖错误和命名错误

最后乖乖收手去Linux系统下打包压缩尝试是否可行

在Linux中,可以使用tar命令将文件或文件夹压缩为.tar.gz格式。

tar 是用于打包文件的命令。

-c 表示创建一个新的归档文件。

-z 表示使用gzip压缩。

-v 表示在归档时显示详细信息。

-f 后面跟着的是归档文件的名称。

例如,想要压缩anaconda中env下的名为VLM的文件夹,可以使用以下命令:

tar -czvf VLM.tar.gz VLM

注意

在Linux里去看位置,anaconda是不显示完整文件目录的,会直接不显示有env文件夹,但是可以直接cd 进env去看

如果想压缩单个文件,比如myfile.txt,可以使用:

tar -czvf myfile.tar.gz myfile.txt

这些命令将在当前目录下创建.tar.gz文件,可以在需要的时候更改文件路径或者指定输出目录。

压缩成功

重新激活环境

3.第三步:激活环境

对于tar压缩来讲解压执行

tar -xzvf VLM.tar.gz

如果是.zip 拷贝到另外一个系统上并解压到目录下/xxxx/anaconda/envs/则为

unzip -d /xxxx/anaconda/envs/  pyenv.zip

注意!打包的虚拟环境记录的是源环境的,新系统上的anaconda安装路径可能和源环境的不一样,比如源环境是/xxxx/anaconda2023/,新系统上是/xxxx/anaconda/,此时需要先在新系统上新建一个和源环境anaconda安装路径一样的空目录,例如原路径\wsl.localhost\Ubuntu\home\test\anaconda3\envs\VLM的

mkdir /xxxx/anaconda3/envs/

然后再建立软链

ln -s /xxxx/anaconda/envs/pyenv /xxxx/anaconda3/envs/

将空目录指向 实际anaconda路径

然后激活环境 source activate /xxxx/anaconda/envs/VLM

希望能顺顺利利完成!

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如果有更好的建议或意见欢迎补充!

我是亓云鹏(亓Qí),努力与大家一同分享算法的快乐!

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Reference:
conda-pack迁移虚拟环境
离线环境conda虚拟环境备份迁移--conda pack问题

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