R语言贝叶斯方法在生态环境领域技术教程

原文链接:R语言贝叶斯方法在生态环境领域技术教程https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzNTczMDMxMg==&mid=2247612056&idx=5&sn=b170122cf5052cc7cb2d858606b9f158&chksm=fa82777fcdf5fe69eec092410530e2900c98bcbb84e3d33c823705c948b4db96545bf282747a&token=1390438349&lang=zh_CN#rd

一:资料
1.1复杂数据回归(混合效应)模型的选择策略
1)科学研究中数据及其复杂性
2)回归分析历史、理论基础
3)回归分析基本假设和常见问题
4)复杂数据回归模型选择策略

1.2 结构方程模型(SEM)生态领域应用

1)SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾

2)SEM的基本结构

3)SEM的估计方法

4)SEM的路径规则

5)SEM路径参数的含义

6)SEM分析样本量及模型可识别规则

7)SEM构建基本流程

1.3如何通过数据探索避免常见统计问题

1)数据缺失(missing value)

2)零值(zero trouble)

3)奇异值/离群值(outliers)

4)异质性(heterogeneity)

5)数据分布正态性(normality)

6)响应变量与预测变量间关系(relationships)

7)交互作用项(interaction)

8)共线性(collinearity)

9)样本独立性(independence)

二:R和Rstudio入门和绘图(含ggplot)
1) R及Rstudio:背景、软件及程序包安装、基本设置等
2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等
3) R语言数据文件读取、整理、结果存储等
4) R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储

三:R语言数据清洗-tidyverse包应用

1)tidyvese: tidyr、dplyr、readr、%>%

2)文件操作:不同格式文件读取、多文件同时读取等

3)数据筛选:行筛选、列筛选、条件筛选(字符操作)等

4)数据生成:数据合并、数据拆分、新数据生成(字符操作)等

5)长宽数据转换、空值(NA)等填充及删除、分组、排序及汇总等

四:贝叶斯回归模型-回归、方差及协防差分析 1)贝叶斯统计
2)贝叶斯回归分析建模、模型诊断、交叉验证、预测和绘图
3)贝叶斯回归分析多预测变量:回归、方差、协方差及交互作用
4)贝叶斯回归模型的过度拟合、共线性、分类变量等

五:贝叶斯混合效应模型-数据分层和嵌套
1)混合效应模型基本原理
2) 贝叶斯效混合应模型建模步骤及实现
3) 贝叶斯的预测和模型诊断
4)贝叶斯混合效应模型的多重比较
5)贝叶斯混合效应模型的方差分解

六:贝叶斯计数数据分析
1)贝叶斯0,1数据分析:二项分布及伯努利分布
2) 贝叶斯泊松分布数据分析
3)贝叶斯过度离散数据分析
4)贝叶斯零膨胀数据分析
5)贝叶斯截断数据分析

七:贝叶斯相关数据分析:时间、空间、系统发育相关数据
1)贝叶斯回归模型方差异质性问题及解决途径
2)贝叶斯时间自相关分析:线性及混合效应模型及时间自相关+方差异质性
3)贝叶斯空间自相关分析:空间距离矩阵、空间邻接关系及矩阵
4)贝叶斯系统发育相关分

八:贝叶斯非线性关系数据分析:广义可加(混合)模型(BGAM/BGAMM)和非线性(混合)(BNLM/BNLMM)模型

1)"线性"回归的含义及非线性关系的判定

2)贝叶斯广义可加(混合效应)(GAM/GAMM)模型

3)贝叶斯非线性(混合效应)(NLM/NLMM)模型

九:贝叶斯结构方程模型(BSEM)
(1) R语言贝叶斯SEM实现程序包blavaan和brms
(2) 气候及生态位重叠程度对田鼠物种丰富度影响:模型比较、直接和间接效应计算(blavaan&brms)
(3) 火烧后对植被恢复影响因素-模型拟合、模型比较和评估(brms)
(4) 生物地理历史因素对北半球森林的初级生产力的影响(brms)

十: 超越贝叶斯统计:因果推断
1)因果推断概述-因果关系之梯
2) 因果推断实现(DAG)
3) 贝叶斯回归VS贝叶斯网络-揭开因果迷雾

:贝叶斯统计结果绘图

1)贝叶斯分析结果数据提取和绘图准备

2)贝叶斯回归模型结果图: 散点图、预测图、箱线图、柱状图、提琴图、密度图及峰峦图等

3)贝叶斯结构方程模型结果图表达

相关推荐
AC赳赳老秦6 小时前
OpenClaw 采集任务日志审计:全程记录采集行为,满足合规溯源与企业审计要求
java·大数据·python·数据挖掘·数据分析·php·openclaw
学术小白人7 小时前
【倒计时4个月】-AI赋能图像处理与计算机视觉技术国际学术研讨会
网络·人工智能·神经网络·数据分析·光学
青春不败 177-3266-05207 小时前
基于“R语言+遥感“水环境综合评价方法实践技术应用
r语言·水环境·水文模型·水遥感·水温模拟
babe小鑫8 小时前
2026低薪岗位转型学数据分析的价值
数据挖掘·数据分析
YangYang9YangYan9 小时前
2026自动化背景无项目经验转数据分析的可行性分析
运维·数据分析·自动化
datagear9 小时前
DataGear 6.0.0 新特性之本地图表
数据分析·html·数据可视化
shujudang10 小时前
企业级 APP 数据分析平台选型指南:业务评估与落地路径
大数据·数据挖掘·数据分析·移动开发
YangYang9YangYan13 小时前
2026通信工程专业学生无项目经验学习数据分析的价值与路径
学习·数据挖掘·数据分析
Patrick在香港1 天前
Python实战:用数据分析拆解一场AI大会——WAIC 2026参展企业画像、议题演变与城市格局
人工智能·python·数据挖掘·数据分析·ai编程
hqyjzsb1 天前
非计算机专业学生怎么进入AI相关方向
人工智能·职场和发展·金融·数据挖掘·数据分析·aigc·业界资讯