读文献先读图:GO弦图怎么看?

GO弦图(Gene Ontology Chord Diagram)是一种用于展示基因功能富集结果的可视化工具,通过弦状连接可以更直观的展示基因与GO term(如生物过程、分子功能等)之间的关联。

GO弦图解读

①内圈连线表示基因和生物过程之间的关联,相同颜色的连线表示这几种基因富集到该term上

②筛选出参与这些个生物过程的基因

③标注显著富集的GO term的名称和颜色标识

④不同颜色代表不同的GO term

GO弦图的适用场景与局限性

适用场景:

展示少量GO term(6-8个)及其关联基因,适合功能富集的概览

比较不同实验条件下的基因功能差异(如疾病vs正常样本)

局限性:

基因或GO term过多时图形易混乱,需缩写或调整字体

无法展示基因间复杂调控网络,需结合其他图表(如网络图)

相关推荐
UQWRJ1 小时前
菜鸟教程R语言一二章阅读笔记
开发语言·笔记·r语言
微光-沫年5 小时前
150-SWT-MCNN-BiGRU-Attention分类预测模型等!
机器学习·matlab·分类
SHIPKING3936 小时前
【机器学习&深度学习】LLamaFactory微调效果与vllm部署效果不一致如何解决
人工智能·深度学习·机器学习
汉唐明月10 小时前
机器学习:使用LSTM训练情感分析模型
机器学习
木头左11 小时前
自动驾驶领域中的Python机器学习
python·机器学习·自动驾驶
风筝超冷13 小时前
【Milvus合集】1.Milvus 的核心概念(collection、field、index、partition、segment)
人工智能·机器学习·milvus
weiwuxian13 小时前
让AI从话痨变成老中医:连续对话的实现秘密
机器学习
Tiger Z13 小时前
《R for Data Science (2e)》免费中文翻译 (第2章) --- Workflow: basics
r语言·数据科学·中文翻译
荼蘼14 小时前
基于 KNN 算法的手写数字识别项目实践
人工智能·算法·机器学习
旧时光巷17 小时前
【机器学习-2】 | 决策树算法基础/信息熵
算法·决策树·机器学习·id3算法·信息熵·c4.5算法