科研绘图工具R语言

目录

前言:

一、下载软件

二、简单绘图

前言:

有的时候需要绘制复杂图形,但是你其实自己也不知道究竟有哪些可以绘制的图,除了散点图,折线图等等,下面就是有一个网站,上面有很多图形,之后也有对应的代码,可以供你选择。

https://www.data-to-viz.com/

一、下载软件

主要需要下载三个软件,第一个是R语言的解释器,第二个是R语言的图形化开发环境,第三个是编译器。

R语言解释器:Index of /bin/windows/base/old/4.4.1

R语言图形化开发环境:RStudio Desktop - Posit

编译器:Rtools44 for Windows

R 的一个事实(很关键)

  • R 包 ≠ 全是 R 代码

  • 很多包内部包含:

    • C

    • C++

    • Fortran

      (为了速度,比如数值计算、优化、图形渲染)

  • 但在 Windows

  • ❌ 默认 没有编译环境

  • 👉 Rtools 就是给 Windows 补上这套"编译工具链"

  • 比如有些包需要从github下载,就必须编译,就需要用这个 remotes::install_github("xxx/xxx")

  • 但是一般的包安装install.packages("tidyverse"),不需要

验证是否Rtools下载成功

Sys.which("make")

二、简单绘图

R 复制代码
# Libraries
library(tidyverse)
library(viridis)

# create a dataset
data <- data.frame(
  name=c(rep("A",500), rep("B",500), rep("B",500), rep("C",20), rep("D", 100)),
  value=c(rnorm(500, 10, 5), rnorm(500, 13, 1), rnorm(500, 18, 1), rnorm(20, 25, 4), rnorm(100, 12, 1))
)

# Plot
p <- data %>%
  ggplot(aes(x=name, y=value, fill=name)) +
  geom_boxplot(outlier.shape = NA) +
  geom_jitter(color="black", size=0.4, alpha=0.6, width=0.2) +
  scale_fill_viridis(discrete = TRUE, alpha=0.6) +
  theme_minimal(base_size = 13) +
  theme(
    legend.position="none",
    plot.title = element_text(size=11)
  ) +
  ggtitle("A boxplot with jitter") +
  xlab("")

print(p)   # ✅ 这一行确保画出来(脚本/块运行时尤其需要)

之后CTRL+A,全选点运行

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