文章目录
- sklearn|机器学习:决策树(一)
-
- (一)概述
- (二)实战
-
- [1. 环境配置](#1. 环境配置)
- [2. sklearn 中的决策树](#2. sklearn 中的决策树)
-
- [(1)模块 `sklearn.tree`](#(1)模块
sklearn.tree
) - [(2)`sklearn` 基本建模流程](#(2)
sklearn
基本建模流程) - [(3)`DecisionTreeClassifier` 与红酒数据集](#(3)
DecisionTreeClassifier
与红酒数据集) -
- [a. `criterion`](#a.
criterion
) -
- [- 信息熵 vs 基尼系数](#- 信息熵 vs 基尼系数)
- [- 参数选取](#- 参数选取)
- [- 决策树基本流程](#- 决策树基本流程)
- [- 代码示例](#- 代码示例)
- [b. `random_state` & `splitter`](#b.
random_state
&splitter
) - [c. 剪枝参数](#c. 剪枝参数)
-
- [- `max_depth`](#-
max_depth
) - [- `min_samples_leaf` & `min_samples_split`](#-
min_samples_leaf
&min_samples_split
) - [- `max_features` & `min_impurity_decrease`](#-
max_features
&min_impurity_decrease
) - [- 最优剪枝参数选择](#- 最优剪枝参数选择)
- [- `max_depth`](#-
- [d. 目标权重参数](#d. 目标权重参数)
-
- [- `class_weight` & `min_weight_fraction_leaf`](#-
class_weight
&min_weight_fraction_leaf
)
- [- `class_weight` & `min_weight_fraction_leaf`](#-
- [a. `criterion`](#a.
- (4)重要属性和接口
- (5)补充
- [(1)模块 `sklearn.tree`](#(1)模块
sklearn|机器学习:决策树(一)
本部分为基于**《菜菜的 sklearn 机器学习》课程的学习笔记,理论部分结合了 周志华《机器学习》**来进行补充,scikit-learn
作为一个开源的 python 机器学习工具包,通过 Numpy, SciPy 和 Matploylib 等 python 数值计算的库实现高效的算法应用,涵盖了几乎所有主流机器学习算法。本课程主要介绍了 sklearn 的全面应用,具体包括 sklearn 中对算法的说明,调参,属性,接口,以及实例应用。
官网:https://scikit-learn.org/stable/index.html
(一)概述
决策树(Decision Tree)是一种非参数的有监督学习 方法,非参数指不限制数据的结构和类型,有监督学习则指必须具有标签。决策树能够从一系列有特征和标签的数据中总结出决策规则,并用树状图的结构来呈现,可用于解决分类和回归问题,其算法本质是一种图结构。
其他以树模型为核心的集成算法还有随机森林、AdaBoost。
以上为基于西瓜好坏问题构建的决策树,其中最初问题所在地方为根结点 (没有进边,有出边,包含最初针对特征的提问),得到结论前的每一个问题为中间节点 (既有进边也有出边,进边只有一条,出边可以有多条,均为针对特征的提问),而得到的每一个结论为叶子结点(只有进边,没有出边,每个叶节点都是一个类别标签)。
子节点 和父节点:在两个相连的节点中,更接近根节点的是父节点,另一个为子节点。
一般而言,决策树由一个根节点、若干个中间节点和若干个叶节点组成,叶节点对应于决策结果。
决策树算法核心问题:
-
如何从数据表中找出最佳节点 和最佳分枝
-
如何让决策树停止生长,防止过拟合
(二)实战
1. 环境配置
本部分环境的安装主要参考了菜菜的开发环境:
此处能够使用 Anaconda,就不推荐使用 pip,因为 pip 安装一部分库的时候可能会出现异常,其默认下载的一部分库的版本可能只适用于 linux 系统,而 Anaconda 的安装一般不会有这个问题。
shell
pip install numpy
pip install pandas
pip install scipy
pip install matplotlib
pip install -U scikit-learn
conda install python-graphviz
注意:Anaconda 的安装和 pip 的安装尽量不要混用,由 Anaconda 安装的库在使用 pip 卸载或是更新的时候,可能出现无法卸载干净,无法正常更新,或更新后一部分库变得无法运行的情况。
2. sklearn 中的决策树
(1)模块 sklearn.tree
sklearn
中决策树的类都在 tree
这个模块下,该模块共包含五类:
tree.DecisionTreeClassifier | 分类树 |
---|---|
tree.DecisionTreeRegressor | 回归树 |
tree.export_graphviz | 将生成的决策树导出为DOT格式,画图专用 |
tree.ExtraTreeClassifier | 高随机版本的分类树 |
tree.ExtraTreeRegressor | 高随机版本的回归树 |
(2)sklearn
基本建模流程
sklearn
具有对所有模型都通用的建模流程,总有以下三步:
其对应分类树的代码为:
python
from sklearn import tree # 导入所需要的模块
clf = tree.DecisionTreeClassifier() # 实例化模型,需要知道所使用的参数,并将其填充在()内
clf = clf.fit(X_train, y_train) # 用训练集数据训练模型,几乎所有模型均可以用fit来训练
result = clf.score(X_test, y_test) # 导入测试集,从接口中调用需要的信息,如score来获取分类模型的accuracy
(3)DecisionTreeClassifier
与红酒数据集
python
class DecisionTreeClassifier(criterion='gini', splitter='best', max_depth=None, min_samples_split=2, min_samples_leaf=1, min_weight_fraction_leaf=0.0, max_features=None, random_state=None, max_leaf_nodes=None, min_impurity_decrease=0.0, class_weight=None, ccp_alpha=0.0)
a. criterion
决策树使用"不纯度"来确定最佳节点和最佳分枝方法,通常来说,"不纯度"越低说明决策树对训练集的拟合越好。不纯度基于节点计算,树中每个节点都有一个不纯度,每一层都有一个加权的不纯度。
在同一棵决策树上,子节点的不纯度一定低于父节点,且叶子结点的不纯度一定是最低的。
criterion
则是用来决定不纯度的计算方法的,其中 sklearn
提供了两种选择,默认使用基尼系数 :
-
输入
entropy
,使用信息熵(Entropy)
E n t r o p y ( t ) = − ∑ i = 0 c − 1 p ( i ∣ t ) l o g 2 p ( i ∣ t ) Entropy(t)=-\sum_{i=0}^{c-1}p(i|t)log_2p(i|t) Entropy(t)=−i=0∑c−1p(i∣t)log2p(i∣t) -
输入
gini
,使用基尼系数(Gini Impurity)
G i n i ( t ) = 1 − ∑ i = 0 c − 1 p ( i ∣ t ) 2 Gini(t)=1-\sum_{i=0}^{c-1}p(i|t)^2 Gini(t)=1−i=0∑c−1p(i∣t)2
其中,t
代表给定节点,i
代表标签的任意分类,p(i|t)
表示标签分类 i
在节点 t
上所占的比例。
当使用信息熵时,sklearn
实际计算的是基于信息上的信息增益,即父节点的信息熵和子节点的信息熵之差,在实际使用中,两者效果相当。
- 信息熵 vs 基尼系数
- 信息熵对不纯度更加敏感,对不纯度的惩罚最强,决策树的生长更精细,但对于高维数据或噪音较多的数据容易过拟合。
- 基尼系数计算更快,因为不涉及对数。
- 参数选取
- 通常使用基尼系数
- 数据维度较大,噪音较大时使用基尼系数
- 纬度低,数据较清晰时,信息熵与基尼系数没有区别
- 当决策树的拟合程度不够(欠拟合)时,使用信息熵
- 两者尝试选择更佳的
- 决策树基本流程
当没有更多特征可用或整体不纯度指标已达到最优时,决策树停止生长。
- 代码示例
python
# 导入模块和算法库
from sklearn import tree
from sklearn.datasets import load_wine
from sklearn.model_selection import train_test_split
# 载入数据集
wine = load_wine()
wine # 字典
wine.data # 提取wine中的特征矩阵
wine.data.shape # 查看数据集格式,共有13个特征,178个样本
wine.target # 提取wine中的标签矩阵
# 如果不输入特征名和标签名,会输出对应的列数,不够直观
wine.feature_names # 查看特征名
wine.target_names # 查看标签名
# 将字典变为表,前13列为特征,最后一列为标签
import pandas as pd
pd.concat([pd.DataFrame(wine.data), pd.DataFrame(wine.target)], axis=1)
# 随机划分训练集和测试集,30%为测试集,70%为训练集,此处需要注意顺序为xxyy
Xtrain, Xtest, Ytrain, Ytest = train_test_split(wine.data, wine.target, test_size=0.3)
Xtrain # 查看划分后的训练集
Xtrain.shape # 查看划分后的训练集的结构,(124, 13)
Xtest # 查看划分后的测试集
Xtest.shape # 查看划分后的测试集的结构,(54, 13)
# Step1:实例化
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy")
# Step2:带入训练数据集进行训练
clf.fit(Xtrain, Ytrain)
# Step3:导入测试集计算模型得分
score = clf.score(Xtest, Ytest) # 返回预测的准确度accuracy
score # 0.9814814814814815,每次训练准确度都不一样
# 可视化
import graphviz
feature_name = wine.feature_names # 可自定义
dot_data = tree.export_graphviz(clf,
feature_names = feature_name,
class_names = ["琴酒","雪莉","贝尔摩德"], # 标签名
filled = True, # 是否填充颜色,颜色越深不纯度越低
rounded = True) # 方框是否圆角
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
节点越往下,不纯度(entropy)越低,当不纯度为0时就可以选出一个标签类别,每个中间节点代表一个特征选择。其中,samples表示样本数,value表示三种label对应的样本数,class表示支持样本数最多的标签,且并非所有特征都会被使用。
python
# 查看feature的贡献度,贡献度越高值越大,根节点对于决策树的贡献永远最高
clf.feature_importances_
# 将feature贡献度与feature name相对应,形成元组
[*zip(feature_name, clf.feature_importances_)]
b. random_state
& splitter
无论决策树模型如何进化,在分枝上的本质都还是追求某个不纯度相关指标的优化,决策树在建树时靠优化节点来追求一颗优化的树,但最优的节点并不能保证最优的树,因此sklearn使用了集成算法来解决该问题,即在每次分枝时,不使用全部特征,而是随机选取一部分特征,再从中选取不纯度相关指标最优的作为分枝用的节点,所以每次生成的树也不同。
random_state
用来设置分枝中的随机模式的参数,默认None,在高维度时随机性会更明显,低维度的数据中随机性几乎不会显现。
python
# 解决随机性问题,random_state 默认为 None
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy", random_state=30)
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
score = clf.score(Xtest, Ytest)
score
splitter
也可以控制决策树中的随机选项,有两种输入值:
- 输入"best",决策树在分枝时虽然随机,但是会优先选择更重要的特征进行分枝;
- 输入"random",决策树在分枝时更加随机,树会更深,对训练集的拟合将会降低,可以防止过拟合。
python
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy",
random_state=30,
splitter="random")
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
score = clf.score(Xtest, Ytest)
score
# 可视化
import graphviz
feature_name = wine.feature_names # 可自定义
dot_data = tree.export_graphviz(clf,
feature_names = feature_name,
class_names = ["琴酒","雪莉","贝尔摩德"], # 标签名
filled = True, # 是否填充颜色,颜色越深不纯度越低
rounded = True) # 方框是否圆角
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
注意:如果模型特征较多,可以使用以上两个参数来降低过拟合的可能性。
c. 剪枝参数
python
# 查看模型对训练集的拟合程度
score_train = clf.score(Xtrain, Ytrain)
score_train
如果模型在训练集上的拟合程度比在测试集上要好得多,则认为存在过拟合的问题,为了使决策树具有更好的泛化能力,需要对决策树进行剪枝。
- max_depth
限制树的最大深度,超过设定深度的树枝全部剪掉(使用最广泛),通常在高纬度低样本量时非常有效,决策树多生长一层,对样本量的需求会增加一倍,所以限制树深度能够有效地限制过拟合,其在集成算法中也非常实用。
实际使用时,建议从=3开始尝试,再根据拟合的效果决定是否增加设定深度。
- min_samples_leaf
& min_samples_split
min_samples_leaf
限定一个节点在分枝后的每个子节点都必须包含至少 min_samples leaf
个训练样本,否则分枝就不会发生,分枝会朝着满足每个子节点都包含 min_samples_leaf
个样本的方向去发生;一般搭配max_depth
使用,可以让模型变得更加平滑,且可以保证每个叶子的最小尺寸,能够在回归问题中避免低方差、过拟合的叶子节点出现。
注意 :min_samples_leaf
设置过小会引起过拟合,设置过大会阻止模型学习数据。一般来说,建议从=5开始使用;如果叶节点中含有的样本量变化很大,建议输入浮点数作为样本量的百分比来使用。对于类别不多的分类问题,=1通常就是最佳选择。
min_samples_split
限定一个节点必须要包含至少 min_samples_split
个训练样本才允许被分枝,否则分枝就不会发生。
python
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy",
random_state=30,
splitter="random",
max_depth=3,
min_samples_leaf=10,
min_samples_split=10)
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
dot_data = tree.export_graphviz(clf,
feature_names = feature_name,
class_names = ["琴酒","雪莉","贝尔摩德"],
filled = True,
rounded = True)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
- max_features
& min_impurity_decrease
max_features
限制分枝时考虑的特征个数,超过限制个数的特征都会被舍弃,是用来限制高维度数据的过拟合的剪枝参数,直接限制可以使用的特征数量而强行使决策树停下。在不知道决策树中的各个特征的重要性的情况下,强行设定可能会导致模型学习不足。
如果希望通过降维的方式防止过拟合,建议使用PCA,ICA或者特征选择模块中的降维算法。
min_impurity_decrease
限制信息增益的大小,信息增益小于设定数值的分枝不会发生,信息增益越大代表该层分枝对于决策树的贡献越大。
- 最优剪枝参数选择
超参数的学习曲线是一条以超参数的取值为横坐标,模型的度量指标为纵坐标的曲线,用来衡量不同超参数取值下模型的表现。
python
import matplotlib.pyplot as plt
test = []
for i in range(10):
clf = tree.DecisionTreeClassifier(max_depth=i+1,
criterion="entropy",
random_state=30,
splitter="random")
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
score = clf.score(Xtest, Ytest)
test.append(score)
plt.plot(range(1,11),test,color="red",label="max_depth")
plt.legend()
plt.show()
注意:调参并非一定能够提升模型在测试集上的表现,当数据集非常大时,建议提前设定剪枝参数来控制树的复杂性和大小,以免内存消耗过大。
d. 目标权重参数
- class_weight
& min_weight_fraction_leaf
当样本存在不平衡,即标签中的某一类天生占有很大的比例,那么构建出的决策树会不可避免地向大比例的部分偏移,如银行在判断"一个办了信用卡的人是否会违约"时是vs否 (1%:99%)的比例,此时即便模型什么也不做,全把结果预测成"否",正确率也能有99%。因此需要使用 class_weight
参数对样本标签进行均衡,给少量的标签更多的权重,该参数默认None,表示自动给与数据集中的所有标签相同的权重。
设定权重后的剪枝将不仅仅只是单纯记录支持样本数,需要搭配 min_weight_fraction_leaf
基于权重来剪枝。
注意 :基于权重的剪枝参数(如 min_weightfraction leaf
)将比不知道样本权重的标准(如 min_samples leaf
)更少偏向主导类;如果样本是加权的,使用基于权重的预修剪标准更容易优化树结构,确保叶节点至少包含样本权重的总和的一小部分。
(4)重要属性和接口
在 sklearn 中,除了 fit
和 score
几乎可以对每个算法使用,还有两个常用的接口:
apply
:输入测试集返回每个测试样本所在叶子结点的索引predict
:输入测试集返回每个测试样本的标签
所有接口中要求输入 Xtrain 和 Xtest 的部分,其输入的特征矩阵必须至少是一个二维矩阵,即至少有两个特征。
注意 :sklearn 不接受任何一维矩阵作为特征矩阵被输入,如果只有一个特征,则需要用reshape(-1,1)
给矩阵增维;如果只有一个特征和一个样本,则需要使用 reshape(1,-1)
来增维。
python
# apply 返回每个测试样本所在叶子结点的索引
clf.apply(Xtest)
# predict 返回每个测试样本的标签
clf.predict(Xtest)
(5)补充
分类树天生不擅长环形数据,每个模型都有自己的决策上限,当一个模型怎么调整都不行的时候,可以选择换其他的模型使用,最擅长月亮型数据的是最近邻算法,RBF支持向量机和高斯过程;最擅长环形数据的是最近邻算法和高斯过程;最擅长对半分的数据的是朴素贝叶斯,神经网络和随机森林。
KNN算法对月亮型和环型数据都具有很好的表现,但可调试范围较小,且计算量较大。