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让学习成为一种生活方式
21 天前
基因组
中药药效成分群的合成生物学研究进展-文献精读130
中药是中华民族的文化瑰宝,也是我国在新药创制领域的重要驱动力。许多中药材来源于稀缺物种,其药效物质的规模化获取困难,是制约中药新药创制研究的重要瓶颈。合成生物学的出现和快速发展为解决这一瓶颈问题提供了新的途径。目前,中药药效物质的合成生物学研究在单个药效分子的生物制备方法上取得了重要进展。中药的药效主要源于多成分作用的叠加和协同,所以药效成分群是中药药效物质的主要形式,然而针对药效成分群的合成生物学研究鲜有报道。建立中药药效成分群合成生物技术的关键是精确调控组成分子的比例,从而产出优质药效成分群。本文首先
zd200572
3 个月前
基因组
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连锁不平衡
【算法工具】HDL: 基于摘要统计数据的高维连锁不平衡分析软件
## 前言在基因组研究中,连锁不平衡(Linkage Disequilibrium, LD)分析是理解遗传变异之间关联的关键步骤。然而,当面对高维数据时,传统分析方法往往面临巨大计算挑战。今天为大家介绍一款强大的工具——HDL (High-Dimensional Linkage disequilibrium),它能够基于GWAS摘要统计数据高效计算连锁不平衡,无需原始基因型数据。
让学习成为一种生活方式
6 个月前
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拟南芥
Ensembl数据库下载参考基因组(常见模式植物)bioinfomatics 工具37
如拟南芥等那么问题来了,基因组fa文件和gff文件在哪里?拟南芥基因组fa在这里注释gff文件在这里
tRNA做科研
6 个月前
linux
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服务器
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conda
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生物信息学
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生物信息
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计算生物学
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最新保姆级Linux下安装与使用conda:从下载配置到使用全流程
目录1.前言2.什么是conda3.miniconda和anaconda的对比与选择4.安装前需要确认的东西(非常重要)
zd200572
9 个月前
gpu算力
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基因组
GPU加速生物信息分析的尝试
实话实说,暂时只有英伟达的GPU才能实现比较方便的基因组分析集成化解决方案,其他卡还需要努力呀,或者需要商业公司或学术团体的努力开发呀!FPGA等这种专用卡的解决方案也是有的,比如某测序仪厂家,某大厂,专门做加速方案的提供商,以及CPU加速方案提供商等。
zd200572
9 个月前
填充
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两个人群填充参考(CHN100K和NARD)
分别是中国人群和东北亚人群的填充参考,测试了下,中国人群的参考注册还是相对友好的,没有像有些网站一样严格限制。东北亚的没有测试,两个数据库的特点都是包含了少数民族,研究朝鲜或蒙古族或其他民族的同学,研究的填充效果会更好,可以测试下!