基因组

【算法工具】HDL: 基于摘要统计数据的高维连锁不平衡分析软件## 前言在基因组研究中，连锁不平衡(Linkage Disequilibrium, LD)分析是理解遗传变异之间关联的关键步骤。然而，当面对高维数据时，传统分析方法往往面临巨大计算挑战。今天为大家介绍一款强大的工具——HDL (High-Dimensional Linkage disequilibrium)，它能够基于GWAS摘要统计数据高效计算连锁不平衡，无需原始基因型数据。

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Ensembl数据库下载参考基因组（常见模式植物）bioinfomatics 工具37如拟南芥等那么问题来了，基因组fa文件和gff文件在哪里？拟南芥基因组fa在这里注释gff文件在这里

最新保姆级Linux下安装与使用conda：从下载配置到使用全流程目录1.前言2.什么是conda3.miniconda和anaconda的对比与选择4.安装前需要确认的东西（非常重要）

GPU加速生物信息分析的尝试实话实说，暂时只有英伟达的GPU才能实现比较方便的基因组分析集成化解决方案，其他卡还需要努力呀，或者需要商业公司或学术团体的努力开发呀！FPGA等这种专用卡的解决方案也是有的，比如某测序仪厂家，某大厂，专门做加速方案的提供商，以及CPU加速方案提供商等。

两个人群填充参考（CHN100K和NARD）分别是中国人群和东北亚人群的填充参考，测试了下，中国人群的参考注册还是相对友好的，没有像有些网站一样严格限制。东北亚的没有测试，两个数据库的特点都是包含了少数民族，研究朝鲜或蒙古族或其他民族的同学，研究的填充效果会更好，可以测试下！